两株西藏CV-B3的全基因组特征及溯源分析

作     者：韩振志 张勇 红梅 黄克强 宋洋 杨倩 严冬梅 祝双利 许文波 HAN Zhenzhi;ZHANG Yong;HONG Mei;HUANG Keqiang;SONG Yang;YANG Qian;YAN Dongmei;ZHU Shuangli;XU Wenbo

作者机构：中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所脊髓灰质炎室世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生健康委员会医学病毒与病毒病重点实验室北京102206 西藏自治区疾病预防控制中心拉萨850000 

出 版 物：《病毒学报》 (Chinese Journal of Virology)

年 卷 期：2018年第34卷第6期

页      面：828-838页

核心收录：

学科分类：1002[医学-临床医学] 100201[医学-内科学(含：心血管病、血液病、呼吸系病、消化系病、内分泌与代谢病、肾病、风湿病、传染病)] 10[医学] 

基　　金：艾滋病、肝炎等传染病防治“十三五”科技重大专项(项目号:2017ZX10104001),题目:基于全基因组的病毒网络化监测和溯源技术体系研究 国家自然科学基金项目(项目号:81672070),题目:引起大规模流行的CV-A6的进化及其导致重症手足口病的分子机制研究 艾滋病、肝炎等传染病防治“十三五”国家科技重大专项(项目号:2018ZX10713002),题目:病毒性传染病病原谱和病毒基因变异变迁规律研究 艾滋病、肝炎等传染病防治“十三五”国家科技重大专项(项目号:2018ZX10713001-003),题目:病毒性自然疫源性传染病症候群病原谱构成及流行规律研究~~ 

主　　题：柯萨奇病毒B组3型(CV-B3) 系统进化分析 重组 溯源分析 

摘      要：肠道病毒是一种常见的引起婴幼儿急性传染病的病毒,它引起的疾病包括急性弛缓性麻痹、手足口病、无菌性脑膜炎和心肌炎等,甚至死亡。柯萨奇病毒B组3型(CV-B3)是引起急性心肌炎常见的病原体之一,并且也经常引起无菌性脑膜炎的暴发。本研究对在西藏自治区分离的两株CV-B3进行全基因组序列测定和分析,结果表明与原型株相比,核苷酸相似性仅为80.6%。通过系统进化分析,中国大陆流行的CV-B3可以分为三个传播链(lineage1～3),从20世纪lineage1便开始在中国传播,现在倾向于消失,目前lineage2和lineage3替代lineage1成为主要的传播链,现在在中国大陆地区传播。本研究的两株CV-B3也被发现可能与江苏省的一株CV-B5(2009-148-4株)在P3编码区发生了重组,且最大似然进化树的拓扑结构的改变也印证这一重组事件的可能性。频繁的重组活动为肠道病毒的进化提供了原始的基因材料,这也成为肠道病毒频繁暴发的原因之一。本研究分析了西藏两株CV-B3的全基因组序列特征,阐明了CV-B3在中国大陆的传播模式,为CV-B3的防控工作提供了基础资料。