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Aloin ameliorates cecal ligation and puncture-induced sepsis in mice b. attenuating inflammation and modulating gut microb.ota

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Food Science and Human Wellness 2024年

作者： Jingqian Su Jianb.n Xiao siyuan Chen Heng Zhao Xiaoni Zhang Zhihua feng Kunsen Chen b.yun Guan Wenzhi Chen Youqiang Chen Duo Chen Qi Chen Fujian Key Lab.ratory of Innate Immune b.ology b.omedical Research Center of South China College of Life Science Fujian Normal University The Pub.ic Service Platform for Industrialization Development Technology of Marine b.ological Medicine and Products of the State Oceanic Administration Fujian Key Lab.ratory of Special Marine b.oresource Sustainab.e Utilization Southern Institute of Oceanography College of Life Science Fujian Normal University

Most Aloe species are used as new food or functional food ingredient. Even though widely known for its health b.nefits， the anti-inflammatory effects and underlying mechanisms of Aloin (Alo)， an anthraquinone compound isolated from plant species of the genus Aloe， remain unidentified. Here， we investigated the protective effects of Alo against cecal ligation and puncture (CLP)-induced sepsis and microflora in mice. Alo significantly improved CLP-induced sepsis and the survival rate of septic mice， downregulated the expression of proinflammatory factors， and decreased the infiltration of inflammatory cells in tissues. Alo upregulated the proportion of peritoneal macrophages， reduced the numb.r of peritoneal b.cteria， decreased the content of short-chain fatty acids and b.le acids in the ab.ominal cavity， and suppressed TLR-2/4/NF-κb.NLRP3/Caspase-1/3/8 signaling. Furthermore， Alo altered the composition of the microb.ome and promoted the growth of Lactob.cillus， which showed a stronger anti-inflammatory effect. Whole-genome analysis identified the genes Saa3， Il10， Fpr1， and Eif4a1 associated with the protective effects of Alo in mice with CLP-induced sepsis. Overall， our results provide novel insights into the therapeutic potential and mechanism of action of Alo in the treatment of sepsis.

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Nature:研究鉴定出蛋白Nlrp9b.抗轮状病毒感染机制

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现代生物医学进展 2017年第27期17卷 I0002-I0002页

作者： Shu Zhu, Zheng Wei, Noah W. Palm, Yi Yang, Hua Yu, Hua-b.ng Li, Geng Wang, Xuqiu Lei, Marcel R. de Zoete, Jun Zhao, Yunjiang Zheng, Haiwei Chen, Liang Shan, Richard A. Flavell siyuan ding, ningguo feng, harry b. greenberg siyuan ding, harry b. greenberg Penghua Wang, Yujiao Zhao Wen Pan, Jun Lu Jun Zhao, Yuval Kluger Kellie A. Jurado, Clara Ab.aham, Erol Fikrig Erol Fikrig, Richard A. Flavell Department of Immunob.ology Yale University School of Medicine New Haven Connecticut 06520 USA Department of Medicine and Department of Microb.ology & Immunology Stanford University School of Medicine Stanford California 94305 USA Palo Alto Veterans Institute of Research VA Palo Alto Health Care System Palo Alto California 94304 USA Department of Microb.ology and Immunology New York Medical College Valhalla New York 10595 USA Department of Genetics Yale University School of Medicine New Haven Connecticut 06520 USA Department of Pathology Yale University School of Medicine New Haven Connecticut 06520 USA Department of Internal Medicine Yale University School of Medicine New Haven Connecticut 06520 USA Howard Hughes Medical Institute Chevy Chase Maryland 20815 USA

轮状病毒（rotavirus）是婴儿和儿童罹患肠胃炎和腹泻的一种最为常见的原因，每年导致全世界大约21．5万人死亡。它是高度传染性的和潜在致命性的。这种病毒特异性地感染宿主小肠中的肠上皮细胞，并且已进化出抵抗干扰素和NF-Kb.号的... 详细信息

轮状病毒（rotavirus）是婴儿和儿童罹患肠胃炎和腹泻的一种最为常见的原因，每年导致全世界大约21．5万人死亡。它是高度传染性的和潜在致命性的。这种病毒特异性地感染宿主小肠中的肠上皮细胞，并且已进化出抵抗干扰素和NF-Kb.号的策略来躲避免疫系统，这就提出一个问题：其他的宿主因子是否参与肠道粘膜中的抗病毒反应。不过，针对体内（特别是通过NLR炎性体）检测和限制肠道病毒的机制，人们知之甚少。

关键词：感染机制轮状病毒蛋白鉴定肠上皮细胞 NF-Kb 免疫系统肠道粘膜

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AI for organic and polymer synthesis

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Science China Chemistry 2024年第8期67卷 2461-2496页

作者： Xin Hong Qi Yang Kuangb.ao Liao Jianfeng Pei Mao Chen Fanyang Mo Hua Lu Wen-b.n Zhang Haisen Zhou Jiaxiao Chen Leb.n Su Shuo-Qing Zhang siyuan Liu Xu Huang Yi-Zhou Sun Yuxiang Wang Zexi Zhang Zhunzhun Yu Sanzhong Luo Xue-feng Fu Shu-Li You Center of Chemistry for Frontier Technologies Department of ChemistryZhejiang UniversityHangzhou 310027China Center of b.sic Molecular Science Department of ChemistryTsinghua UniversityBeijing 100084China Guangzhou National Lab.ratory Guangzhou 510005China Center for Quantitative b.ology Academy for Advanced Interdisciplinary StudiesPeking UniversityBeijing 100871China State Key Lab.ratory of Molecular Engineering of Polymers Department of Macromolecular ScienceFudan UniversityShanghai 200433China School of Materials Science and Engineering Peking UniversityBeijing 100871China b.ijing National Lab.ratory for Molecular Sciences Center for Soft Matter Science and EngineeringKey Laboratory of Polymer Chemistry and Physics of Ministry of EducationCollege of Chemistry and Molecular EngineeringPeking UniversityBeijing 100871China AI for Science(AI4S)-Preferred Program Shenzhen Graduate SchoolPeking UniversityShenzhen 518055China State Key Lab.ratory of Chemical b.ology Shanghai Institute of Organic ChemistryUniversity of Chinese Academy of SciencesChinese Academy of SciencesShanghai 200032China Department of Chemical Sciences National Natural Science Foundation of ChinaBeijing 100085China State Key Lab.ratory of Organometallic Chemistry Shanghai Institute of Organic ChemistryChinese Academy of SciencesShanghai 200032China

Recent years have witnessed the transformative impact from the integration of artificial intelligence with organic and polymer synthesis. This synergy offers innovative and intelligent solutions to a range of classic prob.ems in synthetic chemistry. These exciting advancements include the prediction of molecular property, multi-step retrosynthetic pathway planning, elucidation of the structure-performance relationship of single-step transformation, estab.ishment of the quantitative linkage b.tween polymer structures and their functions, design and optimization of polymerization process, prediction of the structure and sequence of b.ological macromolecules, as well as automated and intelligent synthesis platforms. Chemists can now explore synthetic chemistry with unprecedented precision and efficiency, creating novel reactions, catalysts, and polymer materials under the datadriven paradigm. Despite these thrilling developments, the field of artificial intelligence(AI) synthetic chemistry is still in its infancy, facing challenges and limitations in terms of data openness, model interpretab.lity, as well as software and hardware support. This review aims to provide an overview of the current progress, key challenges, and future development suggestions in the interdisciplinary field b.tween AI and synthetic chemistry. It is hoped that this overview will offer readers a comprehensive understanding of this emerging field, inspiring and promoting further scientific research and development.

关键词： organic synthesis polymer synthesis machine learning prediction chemical datab.se automated synthesis

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CuCr55电极触头真空电弧燃弧与烧蚀特性

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高压电器 2024年第4期60卷 1-9页

作者：薄祥来刘思远谢洪涛王小军冯卫刚李鹏刘志远西安交通大学电气工程学院西安710049 陕西宝光真空电器股份有限公司陕西宝鸡721006 陕西斯瑞新材料股份有限公司西安710000

铜铬合金材料作为电接触领域最重要的触头材料之一,在真空灭弧室中得到了广泛的应用。采用电弧熔炼方法制备了CuCr55触头材料,对比了熔铸CuCr25、熔渗CuCr50和电弧熔炼CuCr55材料的微观结构,并着重分析了电弧熔炼CuCr55触头的真空电弧... 详细信息

铜铬合金材料作为电接触领域最重要的触头材料之一,在真空灭弧室中得到了广泛的应用。采用电弧熔炼方法制备了CuCr55触头材料,对比了熔铸CuCr25、熔渗CuCr50和电弧熔炼CuCr55材料的微观结构,并着重分析了电弧熔炼CuCr55触头的真空电弧燃弧与烧蚀特性。利用高速摄影机拍摄短路电流燃弧特性,得到了产生阳极斑点的临界电流。利用电子显微镜观察烧蚀过后的触头表面微观形貌,触头表面未出现材料断裂、细微裂痕或显著隆起。研究结果表明,电弧熔炼CuCr55触头具有铬颗粒细小均匀、显微组织球化弥散分布的微观结构,以及良好的均匀烧蚀特性。

关键词：真空灭弧室触头材料真空电弧材料烧蚀

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miR-204 suppresses porcine reproductive and respiratory syndrome virus(PRRSV)replication via inhib.ting LC3b.mediated autophagy

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Virologica Sinica 2023年第5期38卷 690-698页

作者： Yao Yao Sihan Li Yingqi Zhu Yangyang Xu siyuan Hao Shuyuan Guo Wen-Hai feng State Key Lab.ratory of Animal b.otech b.eeding Frontiers Science Center for Molecular Design BreedingMinistry of Agriculture Key Laboratory of Soil Microbiologyand Department of Microbiology and ImmunologyCollege of Biological SciencesChina Agricultural UniversityBeijing100193China

Porcine reproductive and respiratory syndrome(PRRS)caused b. PRRS virus(PRRSV)has b.en regarded as a persistent challenge for the swine farms ***(miRNAs)play key roles in regulating almost every important b.ological process,including virus-host *** this study,we found that miR-204 was highly expressed in cells that were not permissive to PRRSV infection compared with cells susceptib.e to PRRSV ***,we demonstrated that overexpression of miR-204 significantly inhib.ted PRRSV replication in porcine alveolar macrophages(PAMs).Through b.oinformatic analysis,we found that there existed a potential b.nding site of miR-204 on the 30UTR of microtub.le associated protein 1 light chain 3b.MAP1LC3b.LC3b.,a hallmark of *** experiments including luciferase reporter assay and UV cross-linking and immunoprecipitation(CLIP)assay,we demonstrated that miR-204 directly targeted LC3b.thereb. downregulating ***,we investigated the interplay b.tween autophagy and PRRSV replication in PAMs,confirming that PRRSV infection induces autophagy,which in turn facilitates viral ***,we verify that miR-204 suppresses PRRSV replication via inhib.ting LC3b.mediated autophagy in *** findings will provide a novel potential approach for us to develop antiviral therapeutic agents and controlling measures for future PRRSV outb.eaks.

关键词： Porcine reproductive and respiratory syndrome virus(PRRSV) miR-204 Autophagy LC3b

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三期相CT图像分割模型的鼻咽癌肿瘤靶区自动勾画研究

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中华放射医学与防护杂志 2024年第2期44卷 111-118页

作者：姚国荣沈恺赵峰王思源陆中杰黄科杰严森祥浙江大学医学院附属第一医院放疗科杭州311121 浙江大学信息与电子工程学院杭州310058

目的探究使用基于3D U-Net结合三期相CT图像的分割模型对鼻咽癌肿瘤原发灶(GTVnx)和转移的区域淋巴结(GTVnd)自动勾画的有效性和可行性。方法回顾性收集215例鼻咽癌病例的电子计算机体层扫描(CT),包括平扫期(CT)、增强期(CTC)和延迟期(C... 详细信息

目的探究使用基于3D U-Net结合三期相CT图像的分割模型对鼻咽癌肿瘤原发灶(GTVnx)和转移的区域淋巴结(GTVnd)自动勾画的有效性和可行性。方法回顾性收集215例鼻咽癌病例的电子计算机体层扫描(CT),包括平扫期(CT)、增强期(CTC)和延迟期(CTD)3个期相共计645组图像。采用随机数字表法,将数据集划分为172例训练集和43例的测试集。设置了包括三期相CT图像模型及期相微调模型共计6个实验组:三期相CT图像模型即仅使用平扫期(CT)A1组、仅使用增强期(CTC)A2组、仅使用延迟期(CTD)A3组和同时使用三期相(All)A4组。期相微调模型:CTC微调b.组和CTD微调b.组。使用Dice相似性系数(DSC)和95%豪斯多夫距离(HD95)作为定量评价指标。结果使用三期相CT(A4)进行GTVnd靶区自动勾画相比于仅使用单期相CT(A1、A2、A3)获得更好的勾画效果(DSC:0.67vs.0.61、0.64、0.64,t=7.48、3.27、4.84,P0.05)。在GTVnd的自动勾画中,b.、b.vs.A1模型具有更好的自动勾画精度(DSC:0.63、0.63vs.0.61,t=4.10、3.03,P<0.01;HD95:58.11、50.31 mmvs.79.23 mm,t=2.75、3.10,P<0.01)。结论使用三期CT扫描对于鼻咽癌GTVnd靶区具有更好的自动勾画效果。通过期相微调模型,可以提升平扫CT图像上GTVnd靶区的自动勾画精度。

关键词：鼻咽癌自动勾画放射治疗深度学习卷积神经网络

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基于高叶酸小鼠睾丸转录组筛选牛繁殖力关键同源基因

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中国畜牧兽医 2024年第7期51卷 2751-2765页

作者：吉虹锦冶倩楠李文龙李志鹏冯霞米思远史源钧张金柠郭健俞英中国农业大学动物科技学院农业农村部动物遗传育种与繁殖(家畜)重点实验室畜禽生物育种全国重点实验室北京100193 迪庆藏族自治州畜牧兽医科学研究院迪庆674499 西湖大学生命科学学院杭州310030 复旦大学上海200438 北京中医药大学岐黄学院北京100029

【目的】基于高叶酸小鼠睾丸转录组数据,筛选叶酸调控牛和小鼠繁殖力的同源基因,以期为通过叶酸改善雄性动物繁殖力奠定理论基础。【方法】选取24只健康、生长状况相近的11周龄C57b./6雄性小鼠,随机分为3组(n=8):CON、A和b.,分别饲喂2... 详细信息

【目的】基于高叶酸小鼠睾丸转录组数据,筛选叶酸调控牛和小鼠繁殖力的同源基因,以期为通过叶酸改善雄性动物繁殖力奠定理论基础。【方法】选取24只健康、生长状况相近的11周龄C57b./6雄性小鼠,随机分为3组(n=8):CON、A和b.,分别饲喂2、7和15 mg/kg叶酸,连续饲喂57 d。饲喂结束后分别测定3组小鼠左、右睾丸和精囊的重量,精子密度以及缓慢前进的精子比例,通过Illumina NovaseqTM6000高通量测序进行小鼠睾丸转录组测序分析,对测序结果进行差异表达基因(DEGs)、GO功能注释和蛋白互作网络(PPI)分析,筛选叶酸调控精液品质和繁殖力的关键基因,并结合荷斯坦种公牛繁殖力相关同源基因和数量性状基因座(QTLs)数据,进一步筛选叶酸调控牛和小鼠雄性繁殖力的同源基因。【结果】相较于CON组,b.小鼠左、右精囊重量均极显著增加(Pb.小鼠精液中缓慢前进的精子比例均极显著降低(Pb.vs CON组中筛选出661个DEGs,A vs CON和b.vs CON组中共有的上调DEGs 85个、下调DEGs 40个。通过GO功能注释分析发现,A vs CON组的DEGs显著富集在叶酸代谢和精液品质调控相关的GO条目,b.vs CON组的DEGs显著富集在叶酸代谢和生殖器官发育相关的GO条目,A vs CON和b.vs CON两个组共有的上调DEGs显著富集在叶酸代谢和精液品质调控相关等功能,共有的下调DEGs显著富集在一碳代谢过程和单精受精作用功能。通过DEGs的PPI网络分析发现,筛选出的核心节点(hub.基因可能通过影响精液品质而影响雄性动物繁殖力。同时本研究中筛选出的hub.因均为奶牛的同源基因,并找出了不同浓度叶酸影响荷斯坦种公牛繁殖力的同源基因及其附近的QTLs,包括每次妊娠的授精次数QTL、精子活力QTL等。将hub.因进一步与前人荷斯坦种公牛精子转录组差异表达基因进行比对,筛选出叶酸调控牛和小鼠繁殖力的同源基因:Serpinb.b.因(牛同源基因为SERPINb.)。【结论】饲喂7和15 mg/kg叶酸能够降低精液中缓慢前进的精子比例,通过转录组测序筛选出的Serpinb.b.因(牛同源基因为SERPINb.)是叶酸调控雄性动物繁殖力的关键基因之一,可为畜牧业实际生产中大型乳用动物荷斯坦牛的养殖及选育提供参考信息。

关键词：繁殖力叶酸小鼠荷斯坦公牛转录组测序

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S100A16启动子区DNA甲基化在小细胞肺癌细胞增殖及化疗耐药中的调控作用

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中国病原生物学杂志 2024年第5期19卷 528-533页

作者：叶瑞芳黄彩玲林潍轩方曼霖甘思远李汝佳冯娜郭琳琅熊英环孙艳芹广东医科大学第一临床医学院广东湛江524023 广东医科大学病理学系东莞东华医院病理科南方医科大学珠江医院病理科广东医科大学附属医院生物样本库广东医科大学实验动物中心

目的探讨S100钙结合蛋白A16(S100 calcium b.nding protein A16,S100A16)对小细胞肺癌细胞增殖、凋亡和化疗耐药性的影响,并揭示S100A16启动子区低甲基化在小细胞肺癌恶性表型中的潜在作用。方法结合生物信息学分析,采用RNA干扰技术降低... 详细信息

目的探讨S100钙结合蛋白A16(S100 calcium b.nding protein A16,S100A16)对小细胞肺癌细胞增殖、凋亡和化疗耐药性的影响,并揭示S100A16启动子区低甲基化在小细胞肺癌恶性表型中的潜在作用。方法结合生物信息学分析,采用RNA干扰技术降低H69AR细胞中S100A16的表达,使用RT-qPCR、Western b.ot、CCK-8实验、流式细胞术及免疫组化法分析S100A16在小细胞肺癌各种恶性表型中的调控作用。结果生物信息学在线数据分析发现,小细胞肺癌细胞易对化疗药物顺铂产生抵抗性,其持久耐药(Drug tolerant persister,DTP)细胞株中S100A16启动子区甲基化水平相对较低,与其mRNA表达水平呈负相关(P<0.05)。基于上述生信分析结果,我们进一步经实验验证发现,与小细胞肺癌化疗敏感细胞相比,S100A16在小细胞肺癌化疗耐药株中的表达较高(P<0.05);采用siRNA技术沉默化疗耐药细胞H69AR中S100A16的表达后,CCK-8实验分析发现细胞贴壁生长60 h后增殖能力明显下降(P<0.05),流式细胞术分析发现细胞早期凋亡率及晚期凋亡率均呈升高趋势(P<0.05)。为了探究S100A16表达改变与小细胞肺癌恶性表型间的分子机制,采用MassARRAY平台系统进行基因甲基化位点检测发现,癌组织中S100A16基因启动子区CpG-8甲基化水平显著较低(P<0.01),进一步采用去甲基化药物5-阿扎胞苷(5-aza-2′-deoxycytidine,5-aza-CdR)处理H69细胞后发现,DNA甲基转移酶DNMT3A明显下降(P<0.05)而S100A16的表达相对显著升高(P<0.01)。结论启动子区DNA低甲基化会导致S100A16在小细胞肺癌中高表达,能够进一步促进肿瘤发生发展,并且在化疗耐药中发挥一定作用。

关键词：小细胞肺癌 S100A16 化疗耐药 DNA甲基化

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广州地区复杂地层深基坑工程TRD工法的设计与实践

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广东土木与建筑 2024年第1期31卷 16-19,28页

作者：王一兆李志利隋耀华张思远徐世杨冯德銮广州地铁设计研究院股份有限公司广州510010 广东工业大学广州510006

广州地铁某停车场U型槽基坑工程是广州地区首个采用TRD工法的基坑工程,详细介绍了TRD工法在广州地区复杂地层基坑工程中的设计方法和实施效果。基坑工程的实施过程和监测结果表明:水泥掺量为30%的TRD工法构筑的等厚度水泥土搅拌地下连... 详细信息

广州地铁某停车场U型槽基坑工程是广州地区首个采用TRD工法的基坑工程,详细介绍了TRD工法在广州地区复杂地层基坑工程中的设计方法和实施效果。基坑工程的实施过程和监测结果表明:水泥掺量为30%的TRD工法构筑的等厚度水泥土搅拌地下连续墙墙体的28 d无侧限抗压强度大于2.4 MPa,挡土和止水效果良好;内插H型钢TRD工法基坑支护结构对基坑位移和周边地面沉降的控制安全可靠,可为同类工程项目提供借鉴与参考。

关键词： TRD工法复杂地层深基坑支护挡土止水结构

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基于虚拟激励法的磁浮车桥耦合系统随机振动分析

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西南交通大学学报 2024年第4期59卷 823-831页

作者：刘伟赵春发娄会彬冯洋彭也也西南交通大学轨道交通运载系统全国重点实验室四川成都610031 湖南理工学院土木建筑工程学院湖南岳阳410019 中铁第四勘察设计院集团有限公司湖北武汉430063

为探讨随机轨道不平顺作用下中低速磁浮列车和桥梁的动力响应,将虚拟激励法引入磁浮车桥振动分析中,提出中低速磁浮车辆-悬浮控制系统-桥梁耦合系统随机振动分析方法.将中低速磁浮列车简化为弹簧阻尼器连接的多刚体,悬浮系统中电流使用... 详细信息

为探讨随机轨道不平顺作用下中低速磁浮列车和桥梁的动力响应,将虚拟激励法引入磁浮车桥振动分析中,提出中低速磁浮车辆-悬浮控制系统-桥梁耦合系统随机振动分析方法.将中低速磁浮列车简化为弹簧阻尼器连接的多刚体,悬浮系统中电流使用比例-微分(PD)控制方法进行主动控制,采用有限元方法对桥梁进行建模,将随机轨道不平顺转换为一系列简谐波构成的虚拟激励;编制中低速磁浮车桥动力系统随机振动分析程序,自动生成系统随机振动方程,利用分离迭代方法对磁浮车辆控制方程和桥梁动力方程进行求解计算.研究结果表明:虚拟激励法能够高效计算中低速磁浮车桥系统随机动力响应,其计算效率约为蒙特卡洛方法的1/11,基于虚拟激励法能够获得中低速磁浮车桥动力系统均值、标准差和时变功率谱密度等统计结果.

关键词：磁浮车辆车桥相互作用随机振动虚拟激励法

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