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Cloning of XET gene from Anthocephalus chinensis and its plant expression vector construction

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Forestry Studies in China 2010年第2期12卷 79-84页

作者： MA Sheng-jun ZHU Song-lin LI Wei ouyang kun-xi LI Na CHEN xiao-yang Key Laboratory for Genetics and Breeding in Forest Trees and Ornamental Plants of Ministry of Education National Engineering Laboratory for Forest Tree Breeding Beijing Forestry University Beijing 100083 P. R. China State-owned Forest Administration of Lvliangshan Mountain Linfen 041000 P. R. China Forestry Research Institute of Hebei Province Shijiazhuang 050061 P. R. China College of Forestry South China Agricultural University Guangzhou 200064 P. R. China

A full-length cDNA sequence of xyloglucan endotransglycosylase gene （XET）, abundantly expressed in the cambium of Anthocephalus chinensis was cloned by conserved PCR, rapid-amplification of cDNA ends and by chromosome walking. Analytical results of the DNA sequence show that a 912 bp complete open reading frame （ORF） encoded a 303-amino acid protein was in the 1205 bp full cDNA sequence. The deduced amino acid sequence of AcXET, which contained the conserved specific EIDFE catalytic site sequence to XETs was homologous to the other known XET proteins. In order to study the gene function of AcXET and obtain transgenic plants, a plant expression vector pBIAcXET was constructed by recombinating the AcXET fragment from the cloning vector pMD19AcXET and the binary vector pBI121 between the XbaI and SmaI sites. The fragment ofAcXET gene was inserted between the CaMV 35S promotor and the coding region of the GUS gene in pBI121. The identification results show that the plant expression binary vector pBIAcXET was constructed successfully. These results lay the foundation for studying the molecular mechanism ofAcXET gene during wood formation.

关键词： cDNA cloning sequence analysis AcXET gene plant expression vector

全基因组关联分析(GWAS)在林木育种中的应用

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植物生理学报 2019年第11期55卷 1555-1562页

作者：阙青敏欧阳昆唏李培陈晓阳华南农业大学林学与风景园林学院广东省森林植物种质创新与利用重点实验室广州510642

全基因组关联分析(genome-wide association studies,GWAS)是近几年发展起来的解析人类、动物或植物表型多样性遗传基础的有效分析手段。GWAS具有高通量、高精度和高速度等显著优点,其在林木遗传育种中的作用日益凸显。本文从种质材料... 详细信息

全基因组关联分析(genome-wide association studies,GWAS)是近几年发展起来的解析人类、动物或植物表型多样性遗传基础的有效分析手段。GWAS具有高通量、高精度和高速度等显著优点,其在林木遗传育种中的作用日益凸显。本文从种质材料、目标性状的选择和表型鉴定、全基因组SNP位点的获取、群体结构、连锁不平衡分析以及关联作图与候选基因发掘等方面对GWAS在林木育种中的应用进行了综述,并提出后续研究展望。以期为进一步利用GWAS技术进行林木育种中各种性状遗传基础的研究提供参考。

关键词：全基因组关联分析(GWAS) 连锁不平衡林木育种

基于Cre/loxP重组系统的多基因载体构建及烟草转化研究

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北京林业大学学报 2010年第5期32卷 121-125页

作者：贾香楠李伟沈俊岭欧阳昆唏陈晓阳北京林业大学林木育种国家工程实验室华南农业大学林学院

利用一套基于Cre/loxP重组系统的植物多基因表达载体系统将苏云杆菌毒蛋白基因(BtCryIAc)、甜菜碱醛脱氢酶基因(BADH)、GA20氧化酶基因(pttGA20ox)和rolB基因构建于植物表达载体pYL1305上,命名为pYL1305BBGR。采用农杆菌介导的叶盘法转... 详细信息

利用一套基于Cre/loxP重组系统的植物多基因表达载体系统将苏云杆菌毒蛋白基因(BtCryIAc)、甜菜碱醛脱氢酶基因(BADH)、GA20氧化酶基因(pttGA20ox)和rolB基因构建于植物表达载体pYL1305上,命名为pYL1305BBGR。采用农杆菌介导的叶盘法转化烟草,经PCR和Southern blot检测发现,多基因已成功转入烟草基因组中;经半定量RT-PCR检测证实,4个基因均能正常表达。

关键词： Cre/loxP重组系统多基因表达载体 BtCrylAc基因 BADH基因 pttGA200x基因 rolB基因

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团花研究现状及发展思考

中南林业科技大学学报 2011年第11期31卷 90-95页

作者：邓小梅欧阳昆唏张倩黄浩陈晓阳华南农业大学广东广州510642 北京林业大学北京100081

团花属茜草科团花属常绿阔叶乔木,是亚洲热带和南亚热带速生树种,在我国华南地区有着较大的开发和应用前景。综述了团花的生物学特性、生长特性、栽培技术、生物技术、化学成分等方面研究进展。针对我国团花产业发展存在的问题,对团花... 详细信息

团花属茜草科团花属常绿阔叶乔木,是亚洲热带和南亚热带速生树种,在我国华南地区有着较大的开发和应用前景。综述了团花的生物学特性、生长特性、栽培技术、生物技术、化学成分等方面研究进展。针对我国团花产业发展存在的问题,对团花人工林发展和利用进行了讨论。

关键词：团花特性栽培技术开发利用

SRAP体系优化及在胡枝子亲缘关系中的应用

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华南农业大学学报 2011年第3期32卷 63-67页

作者：骈瑞琪倪慧群欧阳昆唏李伟陈晓阳华南农业大学林学院广东省森林植物种质创新与利用重点实验室广东广州510642 北京林业大学生物科学与技术学院北京100083 华南农业大学科技处广东广州510642

利用正交设计L16(45)对胡枝子SRAP-PCR反应体系的5种因素(模板、Mg2+、dNTPs、引物、Taq酶)在4个水平上进行优化试验,筛选出各因素的最佳水平,建立了胡枝子SRAP-PCR反应的最佳体系(25μL):模板DNA40 ng,dNTPs 0.16 mmol/L,Mg2+1.5 mmol/... 详细信息

利用正交设计L16(45)对胡枝子SRAP-PCR反应体系的5种因素(模板、Mg2+、dNTPs、引物、Taq酶)在4个水平上进行优化试验,筛选出各因素的最佳水平,建立了胡枝子SRAP-PCR反应的最佳体系(25μL):模板DNA40 ng,dNTPs 0.16 mmol/L,Mg2+1.5 mmol/L,Taq酶1.0 U,引物0.64μmol/L.采用优化的扩增体系对10种胡枝子进行了SRAP分子标记分析.筛选出的10对引物共扩增出274条带,其中244条为多态性带,占89.01%.平均每对24条.多态性条带最多的是引物组合Me21/Em1和Me6/Em9,均达到29条.10种胡枝子种间遗传距离的变异幅度为0.221～0.632.聚类分析表明以0.49为阀值,可以将10种胡枝子分为4大类.

关键词：胡枝子 SRAP 优化亲缘关系

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黄梁木环割促萌正交试验及混合效应模型分析

南方农业学报 2020年第3期51卷 617-622页

作者：阙青敏谭锦豪张登欧阳昆唏陈晓阳李华强华南农业大学林学与风景园林学院/广东省森林植物种质创新与利用重点实验室广州510642 国营雷州林业局广东湛江524348

【目的】开展黄梁木环割促萌正交试验并进行混合效应模型分析,为培育黄梁木高幼化程度无性繁殖材料及黄梁木优良种质资源保存和推广应用打下基础。【方法】以黄梁木成年大树为试验材料,设环割高度和宽度2个因素,环割宽度分别为2、3和4 c... 详细信息

【目的】开展黄梁木环割促萌正交试验并进行混合效应模型分析,为培育黄梁木高幼化程度无性繁殖材料及黄梁木优良种质资源保存和推广应用打下基础。【方法】以黄梁木成年大树为试验材料,设环割高度和宽度2个因素,环割宽度分别为2、3和4 cm及环割高度分别为20、30和40 cm 3个水平的正交试验,共9个处理(处理1~9);环割后每隔1周调查并记录各处理的不定芽发芽数;利用双因素方差分析和线性混合效应模型,分析筛选黄梁木环割促萌最佳条件组合。【结果】处理1的平均发芽数最多,为6.38个,明显多于处理2、处理4、处理8和处理9,显著多于处理3、处理5、处理6和处理7(P0.05,下同),但二者的交互作用对发芽数具有极显著影响(P<0.01);线性混合效应模型分析结果表明,环割高度、环割高度×初始胸径和环割宽度×初始胸径对发芽数有显著影响,环割宽度、初始胸径和环割宽度×环割高度对发芽数无显著影响。【结论】经双因素方差分析和线性混合效应模型分析,黄梁木环割促萌的最佳条件为环割高度20 cm、环割宽度2~3 cm。

关键词：黄梁木环割正交试验设计线性混合效应模型

高校院级实验仪器设备管理存在的问题及对策研究

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教育教学论坛 2019年第12期 9-10页

作者：欧阳昆唏阙青敏黄小玲华南农业大学林学与风景园林学院广东广州510642

随着高校科研实验室迅速发展,学院科研实验室占有的仪器设备在数量、价值上都有显著增加。因此,如何发挥实验仪器设备的最大效益,以及探讨仪器设备管理的重要性十分必要。本文通过对华南农业大学林学与风景园林学院科研实验室仪器设备... 详细信息

随着高校科研实验室迅速发展,学院科研实验室占有的仪器设备在数量、价值上都有显著增加。因此,如何发挥实验仪器设备的最大效益,以及探讨仪器设备管理的重要性十分必要。本文通过对华南农业大学林学与风景园林学院科研实验室仪器设备管理存在的实际问题进行探讨和分析,对谋求提高新时期高校院级教学科研仪器设备管理水平提出了自己的看法。

关键词：仪器设备管理学院实验平台

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基于SRAP分子标记的剑豆遗传多样性分析

中国农业大学学报 2015年第2期20卷 58-66页

作者：刘明骞陈丽君丁美美欧阳昆唏惠文凯李俊成陈晓阳华南农业大学林学院/广东省森林植物种质创新与利用重点实验室广州510642 华南农业大学教学科研基地管理中心广州510642

采用相关序列扩增多态性（Sequence-related amplified polymorphism,SRAP）分子标记方法,对收集到的来源于11个国家的19个剑豆种群进行遗传多样性分析。结果表明：1）在扩增出的274条清晰条带中,具有多态性的有144条,占总数的52.6%;2... 详细信息

采用相关序列扩增多态性（Sequence-related amplified polymorphism,SRAP）分子标记方法,对收集到的来源于11个国家的19个剑豆种群进行遗传多样性分析。结果表明：1）在扩增出的274条清晰条带中,具有多态性的有144条,占总数的52.6%;2）28对引物的多态性指数（Polymorphism information content,PIC）介于0.16~0.43,平均值为0.28;3）剑豆总遗传多样性指数（Ht）为0.285 6,基因流（Nm）为0.065 6;4）通过分子方差分析（Analysis of molecular variance,AMOVA）发现,剑豆种群间差异占总差异的88%,种群内差异占总差异的12%,种群间差异为剑豆差异的主要来源;5）主坐标分析（Principal coordinates analysis,PCoA）和基于遗传距离的聚类分析表明,19个剑豆种群可分为5个类群,每个类群均有不同的表型。

关键词：剑豆相关序列扩增多态性遗传多样性

广东截叶胡枝子根瘤菌株系的发现及其16S rDNA分析

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广东农业科学 2011年第22期38卷 138-140页

作者：刘明骞丁美美欧阳昆唏孙佩光周玮骈瑞琪陈晓阳华南农业大学林学院广东广州510642 北京林业大学生物科学与技术学院北京100083

从截叶胡枝子的根瘤中分离出30个分离物,经纯化、镜检后得到26株待测菌株。将其16S rDNA部分序列测序后用DNAMAN和MAGE 5.0软件进行分析,并与参比菌株相比较。结果表明,去除重复后共获得18株根瘤菌菌株,且可将其分为两大类,分别属于慢... 详细信息

从截叶胡枝子的根瘤中分离出30个分离物,经纯化、镜检后得到26株待测菌株。将其16S rDNA部分序列测序后用DNAMAN和MAGE 5.0软件进行分析,并与参比菌株相比较。结果表明,去除重复后共获得18株根瘤菌菌株,且可将其分为两大类,分别属于慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)和中华根瘤菌属(Sinorhizobium)。

关键词：截叶胡枝子根瘤菌 16S rDNA