基于SRAP分子标记的剑豆遗传多样性分析
Genetic diversity of Canavalia ensiformis(L.)*** revealed by SRAP markers作者机构:华南农业大学林学院/广东省森林植物种质创新与利用重点实验室广州510642 华南农业大学教学科研基地管理中心广州510642
出 版 物:《中国农业大学学报》 (Journal of China Agricultural University)
年 卷 期:2015年第20卷第2期
页 面:58-66页
核心收录:
学科分类:0710[理学-生物学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 090102[农学-作物遗传育种]
基 金:广州市科技计划项目(2010Z1-E241) 农业部"948"项目(2011-Z50)
摘 要:采用相关序列扩增多态性(Sequence-related amplified polymorphism,SRAP)分子标记方法,对收集到的来源于11个国家的19个剑豆种群进行遗传多样性分析。结果表明:1)在扩增出的274条清晰条带中,具有多态性的有144条,占总数的52.6%;2)28对引物的多态性指数(Polymorphism information content,PIC)介于0.16~0.43,平均值为0.28;3)剑豆总遗传多样性指数(Ht)为0.285 6,基因流(Nm)为0.065 6;4)通过分子方差分析(Analysis of molecular variance,AMOVA)发现,剑豆种群间差异占总差异的88%,种群内差异占总差异的12%,种群间差异为剑豆差异的主要来源;5)主坐标分析(Principal coordinates analysis,PCoA)和基于遗传距离的聚类分析表明,19个剑豆种群可分为5个类群,每个类群均有不同的表型。