SRAP体系优化及在胡枝子亲缘关系中的应用
Optimization of SRAP System and Its Preliminary Application in Genetic Relationship Analysis of Lespedeza作者机构:华南农业大学林学院广东省森林植物种质创新与利用重点实验室广东广州510642 北京林业大学生物科学与技术学院北京100083 华南农业大学科技处广东广州510642
出 版 物:《华南农业大学学报》 (Journal of South China Agricultural University)
年 卷 期:2011年第32卷第3期
页 面:63-67页
核心收录:
学科分类:090503[农学-草业科学] 0909[农学-草学] 0907[农学-林学] 090705[农学-野生动植物保护与利用] 0905[农学-畜牧学] 09[农学]
基 金:“863”国家高技术研究发展计划(2002AA241111) 木本豆科饲料植物胡枝子产业化示范项目(2006D90204004)
摘 要:利用正交设计L16(45)对胡枝子SRAP-PCR反应体系的5种因素(模板、Mg2+、dNTPs、引物、Taq酶)在4个水平上进行优化试验,筛选出各因素的最佳水平,建立了胡枝子SRAP-PCR反应的最佳体系(25μL):模板DNA40 ng,dNTPs 0.16 mmol/L,Mg2+1.5 mmol/L,Taq酶1.0 U,引物0.64μmol/L.采用优化的扩增体系对10种胡枝子进行了SRAP分子标记分析.筛选出的10对引物共扩增出274条带,其中244条为多态性带,占89.01%.平均每对24条.多态性条带最多的是引物组合Me21/Em1和Me6/Em9,均达到29条.10种胡枝子种间遗传距离的变异幅度为0.221~0.632.聚类分析表明以0.49为阀值,可以将10种胡枝子分为4大类.