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广西猕猴粪便病毒宏基因组研究

广西猕猴粪便病毒宏基因组研究

作者：敖元云中国疾病预防控制中心

学位级别：硕士

背景:近年来,新发突发传染病屡次发生,对人类健康造成了严重的威胁,已成为目前全球最重要的公共卫生问题之一。2003年的SARS、2005年的禽流感、2009年的甲型H1N1大流感、2012年中东的MERS、2013年我国H7N9禽流感,以及2014年西非埃博拉... 详细信息

背景:近年来,新发突发传染病屡次发生,对人类健康造成了严重的威胁,已成为目前全球最重要的公共卫生问题之一。2003年的SARS、2005年的禽流感、2009年的甲型H1N1大流感、2012年中东的MERS、2013年我国H7N9禽流感,以及2014年西非埃博拉等新发突发传染病都呈现出一个共同特点,即病毒都是动物源性。随着人类活动范围的扩大,人类与野生动物的活动关系越来越亲近,动物病毒感染人类的机会随之增加。据报道70%以上的新发突发传染病都是经过动物传播给人类的,因此动物源性病毒的研究是疾病预防控制的重要内容。近年来,许多具有高致病性的病毒在非人灵长类动物中相继被发现。非人灵长类动物可以作为这些病毒的重要储存宿主,并将其传播给人类,如人类免疫缺陷病毒、埃博拉病毒和马尔堡病毒等。病毒宏基因组学是一种可基于随机PCR和高通量测序技术,并对临床或者环境标本中病毒进行系统的分析和鉴定的方法。猕猴是自然界中最常见的一种猴,分布广泛,且生理上与人类较接近。因此,研究猕猴所携带的病毒谱,对非人灵长类动物的保护以及人类健康的防护具有极其重要的意义。方法:收集我国广西自然保护区龙虎山野生猕猴粪便标本,利用建立好的高通量测序前样品处理方法进行样品处理;构建病毒DNA测序文库、进行Hiseq高通量测序;利用生物信息分析平台对测序后海量数据进行病毒宏基因组学分析,获得猕猴粪便的病毒谱;对一些潜在意义的病毒,进行PCR验证、分子流行病学调查、全基因组的扩增和细胞分离等深入研究,以获得该病毒的流行动态和遗传进化关系等病原学特征。结果:本研究经高通量测序后一共获得340,899,838条序列,其中有1,126,694条序列被注释到病毒。序列分析发现这些病毒序列可以划分为53个病毒科和104个病毒属,包括12个脊椎动物病毒科(包含31个病毒属)、14个无脊椎动物病毒科和18个植物病毒科以及8个噬菌体科。本研究发现的脊椎动物病毒主要集中在小RNA病毒(53%)、小双节病毒(28%)、环状病毒(11%)和细小病毒(6%)等。对这些脊椎动物病毒序列进行深入分析,结果发现猕猴中存在多个新型病毒,主要包括与人星状病毒MLB和VA相近的星状病毒,氨基酸同源性为75-90%;与J组猴肠道病毒具有59%的氨基酸同源性的新型肠道病毒;与B组猴萨佩罗病毒较为接近的新型萨佩罗病毒;与小RNA病毒Falcovirus/Hepotovirus/Tremovirus 具有 24-27%氨基酸同源性的新型小 RNA 病毒;与人博卡病毒具有最高同源性的细小病毒,氨基酸相似度为51-100%;人诺如病毒GII.17和GI.3,核酸同源性高达98%。本研究挑选了肠道病毒(Enterovirus,EV)(命名SEV-gx)和同源性极低的小RNA病毒(命名MobovirusA)进行了深入研究。SEV-gx全基因组长度为7,367个核苷酸。高达10%的阳性检测率提示该病毒能够广泛感染当地猕猴。27个SEV-gx VP1序列所呈现出的100%核酸同源性,提示该病毒在当地猕猴中能够稳定地传播。SEV-gx具有典型的EV基因组结构和特征性结构域。序列比对显示SEV-gx和EV-J具有最高同源性(P1蛋白:43.0-44.1%相似度;P2蛋白:52.3-55.2%相似度;P3蛋白:61.1-62.7%相似度;2C+3C蛋白:<64.0%相似度)。另外,P1和2C以及3D蛋白进化树分析显示SEV-gx在肠道病毒属中形成一个独立进化枝。因此,本研究发现的新病毒应被划为肠道病毒属中的一个新的病毒种(建议命名EV-K)。Mobovirus A基因组全长为8,325个核苷酸。序列比对显示Mobovirus A和小RNA病毒Falcovirus/Tremovirus/Hepatovirus具有较低的同源性,氨基酸相似度分别为P1<22%、P2<24和P3<24%。同时,P1、2C和3D区氨基酸进化树分析显示Mobovirus A在Picornaviriade中形成一个独立进化枝,与Falcovirus/Tremovirus/Hepatovirus在进化关系中最接近。基因组结构分析发现Mobovirus A具有典型的小 RNA病毒科的基因组成特征,即5,UTR-VP2-VP0-VP3-VP1-2A-2B-2C-3A-3B-3C-3D-3'UTR,类似于 Falcovirus/Tremovirus/Hepatovirus。蛋白分析显示Mobovirus A具有小RNA病毒典型的结构域。根据国际病毒学分类委员会建议的小RNA病毒属分类的原则,本研究发现的新病毒应该被归纳为Picornaviriade中新的病毒属(建议命名为Monkey-borne-virus,Mobovirus)。结论:本研究通过病毒宏基因组学方法深入了解到

关键词：猕猴高通量测序病毒宏基因组病毒谱新病毒小RNA病毒肠道病毒

倾斜特厚煤层区段煤柱尺寸及分区围岩控制研究

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采矿与安全工程学报 2024年第2期41卷 232-241页

作者：张博郝兵元任兴云太原理工大学矿业工程学院山西太原030024 太原理工大学安全与应急管理工程学院山西太原030024

为确定倾斜特厚煤层综放工作面沿空掘巷区段煤柱的合理尺寸,以孟家窑煤矿11503综放工作面沿空掘巷为工程背景,基于倾斜煤层基本顶破断之后的岩层结构,建立倾斜煤层工作面“大、小结构”力学模型,推导出适合小结构布置区域的低应力场范... 详细信息

为确定倾斜特厚煤层综放工作面沿空掘巷区段煤柱的合理尺寸,以孟家窑煤矿11503综放工作面沿空掘巷为工程背景,基于倾斜煤层基本顶破断之后的岩层结构,建立倾斜煤层工作面“大、小结构”力学模型,推导出适合小结构布置区域的低应力场范围表达式,并通过“尖点突变”理论分析区段煤柱发生失稳突变的充要条件。采用FLAC^(3D)模拟不同尺寸煤柱的受力及围岩变形规律。研究表明:受到煤层倾角和基本顶关键块回转挤压的影响,煤柱内部破坏形式主要为剪切破坏,破坏区域主要集中在其上部偏向采空区位置;随着煤柱宽度的增大,在沿空掘巷小范围内上覆岩层压力由实体煤承担逐渐转向由煤柱承担;结合应力场、位移场和塑性区变化情况,最终确定煤柱的合理尺寸为15 m。通过分析不同采掘阶段沿空巷道围岩应力分布和演化特征,提出适合不同阶段的围岩控制方案。结合现场工程实践表明,15 m煤柱宽度及围岩控制方案能够满足巷道稳定性要求。

关键词：区段煤柱尺寸突变理论特厚煤层分区围岩控制

中国广西龙虎山野生猕猴粪便的病毒宏基因组学分析

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病毒学报 2016年第3期32卷 273-282页

作者：刘文彬张翠媛虞结梅李利利敖元云段招军湖南师范大学生命科学学院蛋白质化学与鱼类发育生物学重点实验室湖南长沙410081 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所病毒性腹泻室北京100052

非人灵长类携带的病毒种类繁多,其中部分对人具有致病性。为深入了解我国野生猕猴携带病毒的状况,本研究应用MiSeq高通量测序及生物信息学分析技术,对从广西采集的280份猕猴粪便标本进行了病毒宏基因组学的分析。高通量测序共获得了233 ... 详细信息

非人灵长类携带的病毒种类繁多,其中部分对人具有致病性。为深入了解我国野生猕猴携带病毒的状况,本研究应用MiSeq高通量测序及生物信息学分析技术,对从广西采集的280份猕猴粪便标本进行了病毒宏基因组学的分析。高通量测序共获得了233 726 79条读长(Reads),其中4641条序列与病毒相关,进一步注释到27个病毒科(包含细小病毒科中的细小病毒亚科和浓核病毒亚科),包括其中5种脊椎动物病毒(占78.2%)、6种昆虫病毒(占5.5%)、11种植物病毒(占10.4%)、其他的病毒(占9.8%);遗传进化分析结果显示,被注释为萨佩罗病毒、肠道病毒、细小病毒、腺相关病毒等序列与已知病毒相似,部分序列呈现明显的差异;应用PCR扩增进一步证实了病毒序列的真实存在。本研究初步确定了广西地区猕猴粪便中病毒的病毒谱,为深入分析和研究其中有潜在公共卫生意义的病毒奠定了基础。

关键词：病毒宏基因组学猕猴病毒组高通量测序

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水利工程施工中帷幕灌浆技术应用

中文科技期刊数据库（全文版）工程技术 2024年第4期 0182-0185页

作者：敖云江西省明联建设有限公司江西南昌330200

纵观水利工程建设,帷幕灌浆技术以其独到之处显著提升了结构体防渗性能,目前已成为核心的防治水手段。本文旨在探讨帷幕灌浆技术在水利工程施工中的应用及实践挑战。涵盖技术概述,实施步骤,面临的挑战及解决方案三个主要领域。通过深度... 详细信息

纵观水利工程建设,帷幕灌浆技术以其独到之处显著提升了结构体防渗性能,目前已成为核心的防治水手段。本文旨在探讨帷幕灌浆技术在水利工程施工中的应用及实践挑战。涵盖技术概述,实施步骤,面临的挑战及解决方案三个主要领域。通过深度分析当前技术状态,本文揭示了技术的革新方向,对行业前沿动态及未来趋势做出了预测。

关键词：帷幕灌浆技术水利工程防渗实施步骤挑战与解决方案

人力资本积累、服务业成本病治理与就业结构偏向

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经济与管理 2024年第4期38卷 60-69页

作者：王希元张凤云云南大学经济学院云南昆明650500 安徽科技学院财经学院安徽蚌埠233030

“人本”属性是服务业区别于制造业的核心特征,从人力资本视角探讨应对服务业成本病及就业结构低效率转型尤为关键。基于两部门一般均衡模型的理论机制分析发现:人力资本积累能够缓解服务业成本病,但也会拉动服务需求提升;人力资本的成... 详细信息

“人本”属性是服务业区别于制造业的核心特征,从人力资本视角探讨应对服务业成本病及就业结构低效率转型尤为关键。基于两部门一般均衡模型的理论机制分析发现:人力资本积累能够缓解服务业成本病,但也会拉动服务需求提升;人力资本的成本病治理效应导致就业结构偏向工业,需求拉动效应导致就业结构偏向服务业。利用中国2008—2022年省级面板数据的实证分析发现,随着人力资本积累,人力资本对就业结构偏向服务业的影响呈“U型”的非线性关系,当前中国已经跨越“U型”拐点,成本病治理效应小于服务需求拉动效应,人力资本促进就业结构偏向服务业。异质性检验表明,不同区域以及不同人口流动情形会影响人力资本对就业结构的偏向性。

关键词：人力资本服务业成本病就业结构偏向 U型

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诺如病毒河北卢龙株NHBGR59全基因组序列分析

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中华实验和临床病毒学杂志 2016年第3期30卷 266-269页

作者：敖元云虞结梅李莉莉靳淼段招军中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所腹泻室北京100052

目的分析河北卢龙县腹泻儿童粪便标本中存在的诺如病毒株NHBGR59的全基因组序列，了解其基因结构特点和进化特征。方法根据454高通量测序获得的两个重叠群（contig）和诺如病毒参考株序列（GenBank登录号KM198534）设计NHBGR59特异性... 详细信息

目的分析河北卢龙县腹泻儿童粪便标本中存在的诺如病毒株NHBGR59的全基因组序列，了解其基因结构特点和进化特征。方法根据454高通量测序获得的两个重叠群（contig）和诺如病毒参考株序列（GenBank登录号KM198534）设计NHBGR59特异性引物，用重叠反转录聚合酶链反应（ReversetranscriptionPCR，RT—PCR）和cDNA末端快速扩增的技术（rapid—amplificationofcDNAends，RACE）的方法扩增其全长基因，经过分子克隆、测序获得全基因组序列，然后进行三个开放阅读框（OpenReadingFrames，ORFs）序列和系统进化树的分析。结果诺如病毒河北卢龙珠HBGR59病毒全基因组全长为7563bp（除了PolyA尾），病毒基因组分为三个ORFs：ORF1（5～5098nt）、ORF2（5079—6731nt）和ORF3（6731～7510nt），其中ORFl和ORF2之间有20bp重叠，ORF2和ORF3之间有lbp重叠。经过全基因组序列分析发现其和基因组II基因型6（genogroupIIGenotypeVI，GII．6）诺如病毒株30443同源性最高（同源性为98．O％）。ORF2以及ORF3核苷酸和氨基酸序列与株30443同源性最高（分别为97．0％，98．0％；99．0％，98．0％）。ORFI的基因和氨基酸序列与台湾暴发的急性胃肠炎GII．6株11-FJ-5（GenBank号KM461694）同源性最高（99．0％，99．3％），只在高突变P2区发生一个氨基酸突变位点：aa308D—N；其中衣壳区的氨基酸序列与其他GII-6型诺如病毒相似度为73．0％～99．3％。进化树分析发现河北卢龙株HBGR59与GII．6型株30443和11-FJ-5亲缘关系最近。结论河北卢龙株HBGR59为诺如病毒GII．6型，进化关系上与已报道的GII.6型株30443和11-FJ-5最近。

关键词：诺如病毒 GII.6型进化树基因组

基于飞秒啁啾探测脉冲相干反斯托克斯拉曼散射的非稳态燃烧场温度测量

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光学学报 2024年

作者：葛慧云胜章媛宋凯元王伟张盛夏元钦河北工业大学先进激光技术研究中心河北省先进激光与装备重点实验室哈尔滨工业大学可调谐激光技术国家级重点实验室

飞秒相干反斯托克斯拉曼散射光谱具有高时空分辨率、高精确度以及高光谱采集效率，是获得高温湍流燃烧场温度信息的高效工具。针对非稳态高温燃烧场的测温需求，本文利用飞秒啁啾探测脉冲整形相干反斯托克斯拉曼散射（fs CPP）测温方法... 详细信息

飞秒相干反斯托克斯拉曼散射光谱具有高时空分辨率、高精确度以及高光谱采集效率，是获得高温湍流燃烧场温度信息的高效工具。针对非稳态高温燃烧场的测温需求，本文利用飞秒啁啾探测脉冲整形相干反斯托克斯拉曼散射（fs CPP）测温方法,对稳态和非稳态火焰在时间分辨为1 ms时分别进行温度测量，测量结果与热电偶以及文献报道的结果符合较好，其准确度达到1.5%，精确度达到4%，实现了对动态高温燃烧场的毫秒级温度监测，验证了飞秒啁啾探测脉冲相干反斯托克斯拉曼散射光谱在高温非稳态火焰温度测量的准确度和精度的优异性。为大型航空发动机以及超声速发动机进行高速温度测量以及对自制小型高温燃烧装置进行温度标定和性能研究提供了一种可行的方法。

关键词：非线性光学的诊断应用飞秒相干反斯托克斯拉曼散射非稳态燃烧温度测量

基于三元催化剂的固体氧化物燃料电池尾气催化燃烧数值模拟

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发电技术 2024年第2期45卷 331-340页

作者：龚思琦云再鹏许明敖乐李初福黄凯孙晨北京低碳清洁能源研究院北京市昌平区102209 国家能源集团国华巴彦淖尔(乌拉特中旗)风电有限公司内蒙古自治区巴彦淖尔市015000

固体氧化物燃料电池(solid oxide fuel cell,SOFC)作为一种清洁高效的先进发电设备,具有空气、燃料气分离的结构优势,易于将燃料侧尾气中的CO_(2)富集。为提高SOFC阳极尾气中CO_(2)浓度,针对商业化的三元催化剂,综合考虑SOFC阳极尾气催... 详细信息

固体氧化物燃料电池(solid oxide fuel cell,SOFC)作为一种清洁高效的先进发电设备,具有空气、燃料气分离的结构优势,易于将燃料侧尾气中的CO_(2)富集。为提高SOFC阳极尾气中CO_(2)浓度,针对商业化的三元催化剂,综合考虑SOFC阳极尾气催化燃烧中传质、传热、化学反应过程,建立多物理场耦合稳态模型。基于该模型,模拟SOFC系统阳极尾气的催化燃烧特性,研究不同入口温度、反应空速和催化剂尺寸对燃烧温度、壁面温度、H_(2)转化率、CO转化率、出口CO_(2)浓度等参数的影响,得到各参数的变化趋势。借鉴已有实验,通过优化空速,可以将出口CO_(2)浓度从94.72%提高至95.33%;通过优化催化剂尺寸,可以将出口CO_(2)体积分数从94.72%提高至95.64%。通过分析尾气催化燃烧中不同工况下的出口CO_(2)浓度变化特性,为商业三元催化剂用于SOFC系统阳极尾气催化转化和尾气CO_(2)富集提供指导。

关键词：碳排放碳捕集三元催化剂固体氧化物燃料电池(SOFC) 数值模拟

不合规任务对酒店员工退缩行为的影响机制:一个被调节的链式中介模型

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旅游科学 2024年第4期38卷 99-118页

作者：李朋波陈涛黄子欣敖霞高静赵新元北京第二外国语学院旅游科学学院北京100024 中国人民大学劳动人事学院北京100872 澳门科技大学博雅学院中国澳门氹仔999078

不合规任务在酒店企业中的普遍性,以及对员工的消极影响已得到初步验证。然而,现有研究大多探讨不合规任务对酒店员工绩效表现的影响,缺乏对员工消极工作行为及其整合性作用机制的关注。本研究基于资源保存理论和认知-情感人格系统理论... 详细信息

不合规任务在酒店企业中的普遍性,以及对员工的消极影响已得到初步验证。然而,现有研究大多探讨不合规任务对酒店员工绩效表现的影响,缺乏对员工消极工作行为及其整合性作用机制的关注。本研究基于资源保存理论和认知-情感人格系统理论,通过411份酒店一线员工4个时点的有效问卷数据,构建了不合规任务对员工工作退缩行为的链式中介模型,并探讨了员工学习目标导向的多路径调节作用。结果表明:不合规任务对工作退缩行为存在正向影响;工作意义感与和谐型激情在不合规任务与工作退缩行为之间起链式中介作用;学习目标导向分别削弱了不合规任务对工作意义感的负向影响,以及不合规任务对和谐型激情的负向影响,进而负向调节整个链式中介作用。研究结果揭示了不合规任务对酒店员工消极行为的多路径作用机制及其边界条件,对酒店等旅游企业应对不合规任务的负面影响具有指导意义。

关键词：不合规任务工作退缩行为学习目标导向工作意义感和谐型激情