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基于孟德尔随机化分析躯干及下肢脂肪量与椎间盘退变的因果关系

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中国组织工程研究 2024年第35期28卷 5688-5694页

作者：杨敬言马涉黄仁俊王超逸赵余炀于栋北京中医药大学第三临床医学院北京市100029 北京中医药大学第三附属医院北京市100029

背景:近期观察性研究发现局部脂肪量对于椎间盘退变评估有重要意义,而肥胖长期被认为是椎间盘退变的危险因素之一,作为肥胖核心因素的脂肪量在既往研究中与椎间盘退变的因果关系尚不明确。目的:探讨不同分布的脂肪量与椎间盘退变的因果... 详细信息

背景:近期观察性研究发现局部脂肪量对于椎间盘退变评估有重要意义,而肥胖长期被认为是椎间盘退变的危险因素之一,作为肥胖核心因素的脂肪量在既往研究中与椎间盘退变的因果关系尚不明确。目的:探讨不同分布的脂肪量与椎间盘退变的因果关系,以帮助增加对椎间盘退变发病机制的认知及制定预防、治疗及预后的策略。方法:从公开发表的IEU Open GWAS中以强相关性及满足连锁不平衡为条件提取躯干及下肢脂肪量的遗传位点作为工具变量,结合Finn Gen最新第9版数据库中选取椎间盘退变作为结局进行孟德尔随机化分析,通过逆方差加权法、MR-Egger回归、简单中位数法、加权中位数法和加权中值法等回归模型的OR值和95%CI评估躯干及下肢脂肪量与椎间盘退变间的因果关系。使用Cochran’s Q检验评估遗传工具变量的异质性,使用MR-Egger截距检验评估多效性,使用留一法评估作为工具变量的单核苷酸多态性对暴露和结局因果关系影响的敏感性。结果与结论:(1)逆方差加权法检测结果显示,躯干脂肪量与椎间盘退变发病风险呈正向因果关联(OR=1.25,95%CI:1.15-1.35,P<0.001),双下肢脂肪量与椎间盘退变发病风险呈反向因果关联(OR=0.7,95%CI:0.63-0.78,P<0.001;OR=0.69,95%CI:0.62-0.76,P<0.001);(2)MR-Egger截距分析未检测到潜在的水平多效性;(3)MR-PRESSO未检测到偏倚单核苷酸多态性,异质性检验存在,留一法敏感性分析提示分析结果可靠;(4)上述结果证实,躯干脂肪量与椎间盘退变有正向因果关系,随着躯干脂肪量增加,椎间盘退变的风险升高;双下肢脂肪量与椎间盘退变有反向因果关系,即随着双下肢脂肪量增加,椎间盘退变风险降低;脂肪的含量及分布会影响椎间盘退变的发病风险,应给予更多的关注。

关键词：全基因组关联研究孟德尔随机化椎间盘退变脂肪量逆方差加权法敏感性分析单核苷酸多态性因果关系

基础代谢率与椎间盘退变因果关系的孟德尔随机化研究

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中医正骨 2024年第5期36卷 32-38页

作者：赵余炀杨敬言王超逸马涉黄仁俊于栋北京中医药大学第三附属医院北京100029

目的:探讨基础代谢率与椎间盘退变的因果关系。方法:分别从IEU OpenGWAS project数据库和FINNGEN数据库中筛选,获得基础代谢率的全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)数据集和椎间盘退变的GWAS数据集。在分析工具R包... 详细信息

目的:探讨基础代谢率与椎间盘退变的因果关系。方法:分别从IEU OpenGWAS project数据库和FINNGEN数据库中筛选,获得基础代谢率的全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)数据集和椎间盘退变的GWAS数据集。在分析工具R包中从基础代谢率的GWAS数据集中筛选符合要求的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点作为工具变量,根据筛选出的工具变量从椎间盘退变数据集中匹配相应的SNP位点。采用逆方差加权法(inverse variance weighted,IVW)、MR-Egger回归、简单中位数法(simple mode,SM)、加权中值法(weighted median estimator,WME)、加权中位数法(weighted mode,WM)进行孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)分析。采用MR-Egger截距检验、Cochran’s Q检验、留一法进行敏感性分析。结果:纳入90个基础代谢率SNP位点作为工具变量。MR分析结果显示,基础代谢率与椎间盘退变呈负向因果关系[IVW:OR=0.69,95%CI(0.59,0.80),P=0.000;WME:OR=0.69,95%CI(0.58,0.81),P=0.000;MR-Egger:OR=0.59,95%CI(0.42,0.84),P=0.004;WM:OR=0.59,95%CI(0.44,0.81),P=0.001;SM:OR=0.91,95%CI(0.57,1.47),P=0.710]。MR-Egger截距检验结果表明,MR分析结果不存在水平多效性(P=0.358)。异质性检验结果显示,基础代谢率SNP位点存在异质性(P=0.000);采用IVW的随机效应模型再次评估,结果显示基础代谢率与椎间盘退变呈负向因果关系(P=0.000),异质性存在对结果无影响;留一法检验结果显示,无单个SNP位点对基础代谢率与椎间盘退变呈负向因果关系造成影响,MR分析结果稳定。结论:基础代谢率与椎间盘退变呈负向因果关系。

关键词：椎间盘退化基础代谢率孟德尔随机化分析全基因组关联研究

站立身高与椎间盘退变因果关系的孟德尔随机化分析

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中医正骨 2024年第4期36卷 55-61,65页

作者：王超逸杨敬言赵余炀黄仁俊马涉于栋北京中医药大学第三附属医院北京100029

目的:探讨站立身高和椎间盘退变的因果关系。方法:从IEU OpenGWAS project数据库获取站立身高的全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)数据集,筛选符合要求的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点... 详细信息

目的:探讨站立身高和椎间盘退变的因果关系。方法:从IEU OpenGWAS project数据库获取站立身高的全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)数据集,筛选符合要求的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点作为工具变量;从FINNGEN数据库中获取关于椎间盘退变的GWAS数据集,从中筛选与工具变量匹配的SNP位点作为结局变量。将工具变量与结局变量导入分析工具R包,采用逆方差加权法(Inverse variance weighted,IVW)、MR-Egger回归、简单中位数法(Simple mode,SM)、加权中值法(Weighted median estimator,WME)、加权中位数法(Weighted mode,WM)进行孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)分析。采用MR-Egger截距检验、Cochran’s Q检验、留一法进行敏感性分析。结果:MR分析结果显示,站立身高与椎间盘退变呈正向因果关系[MR-Egger:OR=1.148,95%CI(0.942,1.401),P=0.174;WME:OR=1.220,95%CI(1.086,1.371),P=0.000;IVW:OR=1.113,95%CI(1.011,1.226),P=0.030;SM:OR=1.106,95%CI(0.837,1.462),P=0.479;WM:OR=1.234,95%CI(1.004,1.519),P=0.048]。MR-Egger截距检验结果表明,MR分析结果不存在水平多效性(P=0.726);异质性检验结果显示,站立身高SNP位点存在异质性(P=0.000);采用IVW的随机效应模型再次评估,结果显示站立身高与椎间盘退变呈正向因果关系(P=0.000),异质性存在对结果无影响;留一法检验结果显示,MR分析结果稳定。结论:站立身高与椎间盘退变呈正向因果关系。

关键词：椎间盘退化站立身高孟德尔随机化分析全基因组关联研究