应用创造酶切位点法检测MSX2基因多态性
作者单位:山东省医药生物技术研究中心国家卫生部生物技术药物重点实验室山东省罕少见病重点实验室山东省医学科学院
会议名称:《第三届泛环渤海(七省二市)生物化学与分子生物学会——2012年学术交流会》
会议日期:2012年
学科分类:100208[医学-临床检验诊断学] 1002[医学-临床医学] 10[医学]
关 键 词:CRS-PCR-RFLP SNP 酶切
摘 要:目的:探讨应用创造酶切位点法检测基因多态性的思路和方法,有效地对SNP位点进行分型。进而为分析基因的SNP位点等位基因/基因型与疾病之间的关联性提供简便易用的基因SNP检测方法。材料和方法:研究对象为从健康人群血样中提取的DNA 300份。应用创造酶切位点原理设计引物,PCR扩增含MSX2多态位点的DNA片段,根据限制性内切酶SnaBI酶切结果判断MSX2基因SNP位点(rs4868442)多态性。结果和分析:PCR和酶切效果均较好。MSX2基因rs4868442位点GG、GA和从三种基因型在紫外光下清晰可见,因此根据条带即可对SNP位点进行分型。MSX2基因三种基因型PCR产物随机各取6例进行测序鉴定,测序结果与酶切结果一致。结论:本研究建立的MSX2基因SNP位点多态性的检测方法具备简便、经济、快速的特点,PCR产物纯度较高,酶切结果易于分辨。该检测方法通过测序验证,其结果准确可靠。因此可根据酶切结果有效地对SNP位点进行分型,进而分析基因的SNP位点等位基因/基因型与疾病之间的关联性。该方法为今后相关研究提供了更多选择。