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第十五次全国动物遗传育种学术讨论会

作者：李转见陈宏蓝贤勇雷初朝陈忠琦屈玉娇刘艳丽李明勋房兴堂西北农林科技大学动物科技学院陕西省农业分子生物学重点实验室徐州师范大学细胞与分子生物学研究所

＜正＞引言羊奶被誉为"奶中之王",羊奶具有极高的营养价值。在哺乳动物中,weaver基因编码G蛋白偶联内向整流钾通道蛋白的亚单元,属于内向整流钾通道4个亚家族中的一员,在各种组织中广泛分布,特别在中枢神经系

关键词：奶山羊 weaver基因 DNA池 crs-pcr-rflp

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6个绵羊群体MC4R基因crs-pcr多态性及其与湖羊、东湖杂交羊生长性状的关联分析

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南京农业大学学报 2014年第1期37卷 121-126页

作者：王春玲茆达干曹少先张俊孟晨玲方永飞朱冬冬南京农业大学动物科技学院江苏南京210095 江苏省农业科学院畜牧研究所江苏南京210014 上海永辉羊业有限公司上海201808 上海市嘉定区动物疫病预防控制中心上海201800

为了探讨黑素皮质素受体4(melanoeortin receptor-4,MC4R)基因在绵羊中的多态性以及多态位点对绵羊生长性状的影响,对湖羊MC4R基因进行扩增,测序后发现9个碱基置换,选择MC4R基因548位点处C/T的单碱基突变,建立crspcr-rflp分析方法,并对... 详细信息

为了探讨黑素皮质素受体4(melanoeortin receptor-4,MC4R)基因在绵羊中的多态性以及多态位点对绵羊生长性状的影响,对湖羊MC4R基因进行扩增,测序后发现9个碱基置换,选择MC4R基因548位点处C/T的单碱基突变,建立crspcr-rflp分析方法,并对6个绵羊群体(湖羊、东弗里生羊×湖羊(东湖杂交羊)、中国美利奴、Romney、中国美利奴×Romney和阿勒泰)共518个个体进行检测分析。结果表明:在阿勒泰、Romney、中国美利奴×Romney群体中仅检测到CC 1种基因型,在东湖杂交羊和中国美利奴的群体中检测到CC和CT 2种基因型,而在湖羊群体中检测到CC(0.865)、CT(0.126)和TT(0.009)3种基因型。湖羊群体CT基因型2月龄体质量显著高于TT基因型(P<0.05),4月龄体长显著高于CC型(P<0.05)和TT型(P<0.01);东湖杂交羊群体中CT基因型的4月龄体高显著高于CC基因型(P<0.05)。本研究初步表明6个绵羊群体中MC4R基因的CT基因型具有生长优势。

关键词：黑素皮质素受体4 crs-pcr-rflp 绵羊生长性状

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猪GHR基因两个SNPs位点多态性与生长性状的关联分析

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南方农业学报 2014年第11期45卷 2052-2057页

作者：杨慧陈宝剑兰干球郭亚芬蒋钦杨杨秀荣广西大学动物科学技术学院南宁530005

【目的】探讨猪GHR基因两个SNPs位点多态性与其生长性状的相关性,为保护广西巴马小型猪的遗传资源及推进猪分子标记辅助育种技术的发展奠定基础。【方法】采用pcr-rflp和错配pcr-rflp(crs-pcr-rflp)检测巴马小型猪×长白猪杂交F2代(简... 详细信息

【目的】探讨猪GHR基因两个SNPs位点多态性与其生长性状的相关性,为保护广西巴马小型猪的遗传资源及推进猪分子标记辅助育种技术的发展奠定基础。【方法】采用pcr-rflp和错配pcr-rflp(crs-pcr-rflp)检测巴马小型猪×长白猪杂交F2代(简称巴×长F2代)资源家系中猪GHR基因G1248A和A1801G两个SNPs位点的多态性,并对其相关生长性状进行关联分析。【结果】猪GHR基因G1248A和A1801G两个SNPs位点在巴×长F2代资源家系中均表现出AA、AG和GG 3种基因型。G1248A位点对巴×长F2代生长性状的影响表现为:除2月龄GG基因型个体的胸围尺寸显著大于AA、AG基因型个体(P0.05,下同)。A1801G位点对巴×长F2代生长性状的影响表现为:除1和6月龄GG基因型个体的体高显著低于AA、AG基因型个体,3和6月龄GG基因型个体的胸围尺寸显著大于AA、AG基因型个体外,其他月龄的相关生长性状在不同基因型个体间差异也不显著。【结论】猪GHR基因G1248A位点的G等位基因对个体体重、胸围有正选择作用,而A1801G位点的G等位基因对个体体高有负选择作用,对个体胸围有正选择作用,均可作为猪分子标记辅助育种的遗传选择标记。

关键词：猪 GHR基因 SNP位点多态性 pcr-rflp crs-pcr-rflp 生长性状关联分析

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猪APOBEC3F基因外显子6单核苷酸多态性及其与PRRSV易感性的关联分析

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畜牧与兽医 2014年第5期46卷 48-52页

作者：朱前明孟春花李静心王慧利王亚磊王婧茆达干曹少先南京农业大学动物科技学院江苏南京210095 江苏省农业科学院畜牧研究所江苏南京210014

载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽3F(APOBEC3F)是有效阻止内源性与外源性反转录病毒复制的新型宿主细胞因子。本文对猪APOBEC3F基因外显子6序列进行扩增和测序,筛选多态性位点,并分析其与PRRSV易感性的相关性。测序发现外显子6存在3个单碱... 详细信息

载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽3F(APOBEC3F)是有效阻止内源性与外源性反转录病毒复制的新型宿主细胞因子。本文对猪APOBEC3F基因外显子6序列进行扩增和测序,筛选多态性位点,并分析其与PRRSV易感性的相关性。测序发现外显子6存在3个单碱基突变(g.337 T/G、g.341 G/A和g.343 T/C)。针对g.341 G/A建立crs-pcr-rflp方法,检测9个猪群193个样本,发现仅在姜曲海猪和梅山猪中有GG(0.79/0.80)和GA(0.21/0.20)基因型,其他7个猪群体只检测到GG基因型。GG基因型猪肺泡巨噬细胞中PRRSV拷贝数在接毒后18h显著高于GA基因型个体(P<0.05)。表明APOBEC3F基因外显子6与猪种PRRSV抗性相关,外显子6的341位点A等位基因更有利于抵抗PRRSV的感染,这为进一步探讨APOBEC3F基因作为猪种PRRSV抗性辅助选育标记提供了试验依据。

关键词：载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽3F crs-pcr-rflp PRRSV 易感性

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固始鸡—安卡鸡F2代资源群Myf5基因多态性研究

固始鸡—安卡鸡F2代资源群Myf5基因多态性研究

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作者：马新红河南农业大学

学位级别：硕士

本研究以我国优质地方蛋肉兼用品种固始鸡和快大型肉鸡安卡鸡为素材,采用pcr-SSCP、DNA测序、crs-pcr-rflp等技术,对F代群体中生肌因子5(Myf5)基因的遗传多态性进行了研究,并通过最小二乘分析评价了该基因变异位点与主要经济性状的关联... 详细信息

本研究以我国优质地方蛋肉兼用品种固始鸡和快大型肉鸡安卡鸡为素材,采用pcr-SSCP、DNA测序、crs-pcr-rflp等技术,对F代群体中生肌因子5(Myf5)基因的遗传多态性进行了研究,并通过最小二乘分析评价了该基因变异位点与主要经济性状的关联性。主要结果如下: (1)本研究在鸡的生肌因子5的外显子1上引入MspI酶切位点,MspI酶切位点为C?CGG,相对原序列CCGA突变了一个碱基,在pcr产物中包含这个酶切位点。经测序和序列比对表明,该位点T188C(NC06088)是同义突变,没有引起氨基酸序列的变化。在该群体中AB基因型居多,AA、BB基因型的检出率相对比较低,等位基因A为优势基因, AB基因型为优势基因型。PIC为0.375,属中度多态,经χ2适合性检验,该位点在该群体极显著的偏离了Hardy—weinberg平衡(Ppcr-SSCP检测后,取pcr产物直接进行测序,共检测到两个变异位点即A533G和T632C(NC06088),此两个突变位点均没引起氨基酸序列的变化,属同义突变。其中CD基因型居多,CC、DD基因型的检出率相对比较低,等位基因C为优势基因,CD基因型为优势基因型。PIC为0.373,属中度多态,经χ2适合性检验,突变位点在该群体中极显著的偏离了Hardy—weinberg平衡(P

关键词：鸡 F2资源群体 Myf5 crs-pcr-rflp pcr-SSCP

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应用创造酶切位点法检测MSX2基因多态性

应用创造酶切位点法检测MSX2基因多态性

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第三届泛环渤海（七省二市）生物化学与分子生物学会——2012年学术交流会

作者：刘泽英崔亚洲周小艳韩金祥山东省医药生物技术研究中心国家卫生部生物技术药物重点实验室山东省罕少见病重点实验室山东省医学科学院

目的:探讨应用创造酶切位点法检测基因多态性的思路和方法,有效地对SNP位点进行分型。进而为分析基因的SNP位点等位基因/基因型与疾病之间的关联性提供简便易用的基因SNP检测方法。材料和方法:研究对象为从健康人群血样中提取的DNA 300... 详细信息

目的:探讨应用创造酶切位点法检测基因多态性的思路和方法,有效地对SNP位点进行分型。进而为分析基因的SNP位点等位基因/基因型与疾病之间的关联性提供简便易用的基因SNP检测方法。材料和方法:研究对象为从健康人群血样中提取的DNA 300份。应用创造酶切位点原理设计引物,pcr扩增含MSX2多态位点的DNA片段,根据限制性内切酶SnaBI酶切结果判断MSX2基因SNP位点(rs4868442)多态性。结果和分析:pcr和酶切效果均较好。MSX2基因rs4868442位点GG、GA和从三种基因型在紫外光下清晰可见,因此根据条带即可对SNP位点进行分型。MSX2基因三种基因型pcr产物随机各取6例进行测序鉴定,测序结果与酶切结果一致。结论:本研究建立的MSX2基因SNP位点多态性的检测方法具备简便、经济、快速的特点,pcr产物纯度较高,酶切结果易于分辨。该检测方法通过测序验证,其结果准确可靠。因此可根据酶切结果有效地对SNP位点进行分型,进而分析基因的SNP位点等位基因/基因型与疾病之间的关联性。该方法为今后相关研究提供了更多选择。

关键词： crs-pcr-rflp SNP 酶切

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