全转录组测序在儿童急性B淋巴细胞白血病中的应用及KMT2A-USP2融合基因阳性婴儿白血病1例并文献复习

作     者：邹品力 

作者单位：重庆医科大学 

学位级别：硕士

导师姓名：肖剑文

授予年度：2021年

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

主      题：急性B淋巴细胞白血病 全转录组测序 二代测序 融合基因 分子遗传学 婴儿白血病 KMT2A-USP2 全外显子测序 

摘      要：第一部分 全转录组测序在儿童急性B淋巴细胞白血病中的应用目的:探索儿童急性B淋巴细胞白血病（B-ALL）的分子遗传学学特点及全转录组测序（RNA-seq）在儿童B-ALL中的应用价值。方法:收集并分析2015.05-2020.04重庆医科大学附属儿童医院血液肿瘤中心收治的初诊急性B淋巴细胞白血病（B-ALL）患儿的临床及其实验资料,所有患儿均经骨髓形态学及组织化学染色、流式细胞术确诊,且完善染色体核型分析、FISH、RT-PCR及RNA-seq检测。结果:129例初诊B-ALL患儿中男72人,女57人,平均月龄69±47月,共99例患儿检出融合基因阳性,阳性率76.7%。共86人检测出白血病相关及可能相关基因突变阳性,阳性率约66.7%。ETV6-RUNX1、BCR-ABL1、TCF3-PBX1、KMT2A重排检出率在FISH、RT-PCR、RNA-seq中无明显差异,此外RNA-seq检出较多罕见的融合,包括KMT2A-USP2 1例、Ph样相关融合基因4例、MEF2D重排5例、PAX5重排5例、ZNF384重排3例等,以及意义暂不明确或尚未在白血病患儿中报道的融合基因若干。其中ETV6-RUNX1融合基因阳性患儿诱导缓解治疗反应好,BCR-ABL1及ZNF384重排阳性患儿诱导反应差,差异有统计学意义（P0.05）。结论:全转录组测序不仅能检测出已知的融合基因,同时能发现新的及罕见的融合基因及基因突变,其应用对B-ALL患儿危险度分级及精准靶向治疗有重要指导意义。第二部分 KMT2A-USP2融合基因阳性婴儿白血病1例并文献复习目的:通过报道首例国内KMT2A-USP2融合基因阳性急性淋巴细胞白血病（ALL）患儿1例并复习相关文献,探讨KMT2A-USP2融合基因阳性患儿的临床特征及分子遗传学特点,为婴儿白血病的诊疗提供参考。方法:收集1例2018年8月我科住院婴儿白血病合并KMT2A-USP2基因阳性患儿的临床资料及并结合复习文献。结果:患儿荧光原位杂交技术（FISH）及多重巢式逆转录聚合酶链反应技术（RT-PCR）均为阴性,全外显测序（WES）提示ATM、CASC5、LPP和PDGFRB致病基因突变,全转录组测序（RNA-seq）检出融合基因KMT2A-USP2,确诊后患儿予以CCCG-ALL-2015方案化疗,治疗反应差,截止随访时间患儿已获得完全缓解共25月。结论:KMT2A重排高发于婴儿白血病,对于常规手段示KMT2A重排阴性婴儿白血病患儿应考虑予以全外显子及全转录组测序有无合并罕见KMT2A重排,同时应加强化疗强度以达到微小残留病缓解,有条件者应考虑异基因造血干细胞移植。