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采用表达谱芯片筛选初治非小细胞肺癌含铂方案化疗敏感组与耐药组之间的差异表达基因

作     者:郑泽斌 

作者单位:广西医科大学 

学位级别:硕士

导师姓名:谢伟敏

授予年度:2013年

学科分类:1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

主      题:非小细胞肺癌 表达谱芯片 化疗 铂类耐药 

摘      要:目的利用Affymetrix公司的寡核苷酸表达谱芯片筛选非小细胞肺癌(NSCLC)含铂联合化疗方案化疗敏感组与耐药组之间的差异表达基因,初步确定与铂类耐药相关的基因(或基因群)。 方法分别收集8例NSCLC含铂联合化疗方案化疗敏感病例与耐药病例的外周静脉血,采用美国Affymetrix公司的Human Genome U133Plus2.0表达谱芯片,按一步法抽提mRNA并纯化,经逆转录合成渗入生物标记的cDNA合成探针,经芯片杂交及严格洗片后,用荧光扫描仪扫描芯片荧光信号图像,比较化疗敏感组与耐药组之间的差异表达基因。 结果按差异显著性标准(差异倍数Fold Change≥2.0倍或≤0.5),从38500个基因中筛选出两组间差异表达基因195条,其中,上调基因162个(Fold Change≥2.0),下调基因33个(Fold Change≤0.5),在上、下调基因中包括免疫应答、炎症反应、趋化因子、信号转导、转录调节、细胞迁移、细胞周期、细胞粘附、抗凋亡、神经递质运输、负调控细胞周期、细胞分化、氧化还原等相关基因。 结论用核苷酸表达谱芯片能筛选出非小细胞肺癌含铂联合化疗方案化疗敏感组与耐药组之间的差异表达基因,多基因参与了肿瘤细胞对铂类的耐药过程,对这些差异表达基因做进一步做功能分类及验证有助于阐明肺癌对铂类的耐药机理。

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