用cDNA微阵列技术快速筛选粗毛栓菌的表达基因(英文)

作     者：孙迅 江明锋 李校 张义正 SUN Xun, JIANG Ming-Feng, LI Xiao, ZHANG Yi-Zheng ** (Life Science College of Sichuan University, Sichuan Key Laboratory of Molecular Biology and Biotechnology, Chengdu 610064, China)

作者机构：四川大学生命科学学院四川省分子生物学和生物技术重点实验室成都610064 

出 版 物：《生物化学与生物物理进展》 (Progress In Biochemistry and Biophysics)

年 卷 期：2004年第31卷第4期

页      面：356-360页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：国家自然科学基金资助项目 ( 3 0 170 5 13 )~~ 

主　　题：cDNA微阵列 粗毛栓菌 黄孢原毛平革菌 同源性分析 克隆 

摘      要：利用cDNA微阵列技术快速筛选具有较强降解木质纤维素能力的白腐真菌粗毛栓菌 (Trametesgallica)的表达基因 .利用木质素生物降解模式菌株黄孢原毛平革菌 (Phanerochaetechrysosporium)的cDNA制备研究所用微阵列 .在含有2 5 96个cDNA片段的芯片上共检测到 172个阳性克隆 ,其中有 16 5个克隆的荧光信号比值 (Cy 5 /Cy 3)在 0 5和 2 0之间 ,占所检测阳性克隆数的 95 9% .对应于在限氮条件下生长 5天和 12天的粗毛栓菌培养物 ,分别有 3个和 4个时序特异性差异表达基因 .随机挑取 12 2个克隆进行测序和序列比对 ,发现所测序列中有 118个能够很好地定位于黄孢原毛平革菌的基因组上 .结果显示 ,粗毛栓菌与黄孢原毛平革菌在表达序列上存在较大差异 ,表明这两种真菌之间存在着较远的亲缘关系 .通过同源性比对分析 ,发现 2个令人感兴趣的克隆 ,一个对应于黄孢原毛平革菌过氧化物酶基因lpoB的部分片段 ,另一个为编码一种热激蛋白的基因 .