细胞黏附分子互作网络的构建与分析
Construction and Analysis for Molecular Interaction Network of Cell Adhesion作者机构:重庆工商大学环境与生物工程学院药物化学与化学生物学研究中心重庆400067
出 版 物:《生物化学与生物物理进展》 (Progress In Biochemistry and Biophysics)
年 卷 期:2011年第38卷第4期
页 面:347-352页
核心收录:
学科分类:0710[理学-生物学] 0831[工学-生物医学工程(可授工学、理学、医学学位)] 071010[理学-生物化学与分子生物学] 081704[工学-应用化学] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-化学工程与技术] 0703[理学-化学]
基 金:国家自然科学基金(31070830) 重庆市自然科学基金(CSTC2008BB5329) 重庆市教委自然科学基金(KJ080706)资助项目~~
摘 要:借助网络分析可对基因调控、蛋白质互作和信号转导等细胞活动进行全局和局部性质分析.以细胞黏附的蛋白质相互作用为对象,通过数据挖掘和可视化软件构建了整合蛋白介导的黏附分子互作网络,该分子互作网络由156种蛋白质通过690种相互作用相连,其平均节点度为8.66、平均聚集系数为0.24,平均路径长度为2.6.黏附分子互作网络中包含数个功能模块,这些模块涉及网络内部多种分子相互作用的启动与停止,并进一步影响细胞的黏附、迁移和骨架组织.对黏附分子网络进行模体筛选和比较,发现一些数量相对较少、以三元复合物为主要结构的关键模体,同时对各网络模块和模体对细胞黏附的调控作用进行了探讨.