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系统生物学在中药成分抗肝纤维化中的研究进展

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中国医药科学 2024年第10期14卷 21-25页

作者：申敏蔡良良钱莉扬州大学医学院江苏扬州225009

肝纤维化是慢性肝损伤发展为肝硬化甚至肝癌的必经阶段,其病理和生理过程复杂,是目前肝病治疗领域的难点。中医药治疗肝纤维化注重整体调理,以病机为基础,辨证施治,具有独特的优越性。系统生物学的系统整合研究方法与中医药的整体治疗... 详细信息

肝纤维化是慢性肝损伤发展为肝硬化甚至肝癌的必经阶段,其病理和生理过程复杂,是目前肝病治疗领域的难点。中医药治疗肝纤维化注重整体调理,以病机为基础,辨证施治,具有独特的优越性。系统生物学的系统整合研究方法与中医药的整体治疗观念不谋而合,系统生物学利用组学研究方法探究肝纤维化病理机制与治疗策略,为寻找理想的抗肝纤维化治疗方法和靶向药物提供了新的研究思路。本文对近年系统生物学方法在中医药抗肝纤维化中的研究与应用进行综述。

关键词：肝纤维化中医药系统生物学组学

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中药复方SQQT对胃黏膜解痉多肽表达化生细胞干预作用及其系统生物学机制解析

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中国中西医结合消化杂志 2024年第5期32卷 392-400页

作者：刘林王萍吉海杰孙元隆刘炯唐旭东中国中医科学院西苑医院脾胃病研究所北京100091 山西省中医药研究院中心实验室上海中医药大学附属曙光医院心内科中国中医科学院西苑医院病理科

目的:研究中药复方SQQT对胃黏膜解痉多肽表达化生(SPEM)细胞病理表型的影响,探讨其干预SPEM细胞病理演变的可能效应机制。方法:回顾性分析以SQQT为主方的中药辨证方对临床不同部位胃黏膜癌前病变的干预效果和SPEM细胞分布情况;评估SQQT... 详细信息

目的:研究中药复方SQQT对胃黏膜解痉多肽表达化生(SPEM)细胞病理表型的影响,探讨其干预SPEM细胞病理演变的可能效应机制。方法:回顾性分析以SQQT为主方的中药辨证方对临床不同部位胃黏膜癌前病变的干预效果和SPEM细胞分布情况;评估SQQT对小鼠模型SPEM细胞病理表型的影响;利用超高效液相色谱、单细胞RNA转录数据挖掘和网络药理学分析等系统生物学方法构建“成分-靶点”网络图谱,并进行拓扑分析。结果:(1)中药辨证方可有效减轻胃癌前病变患者胃体黏膜萎缩、肠化、异型增生的程度,抑制胃体黏膜基底部SPEM细胞的形成;(2)SQQT可显著降低他莫昔芬复合法诱导的增殖型SPEM小鼠胃体黏膜SPEM细胞数量,并有效抑制SPEM细胞Ki67和CD44v9标记蛋白的异常表达;(3)本研究从复方中共鉴定出27种成分和118个靶点与增殖型SPEM细胞的病理转变密切关联。拓扑分析显示,SQQT主要通过调控细胞能量代谢、核糖体功能、细胞通讯、凋亡信号通路等,影响SPEM细胞的增殖和分化功能。有6种化学成分(柠檬酸、根皮酚、去甲基吴茱萸酰胺、吴茱萸黄碱、橙皮苷和人参皂苷Re)同时参与调节SPEM细胞的线粒体ATP合成电子转运、氧化还原膜转运体活性以及核糖体功能,可能是SQQT调控SPEM细胞病理演变的潜在物质基础。结论:中药复方SQQT通过多种成分对应多个靶点的整体调控作用,实现抑制胃黏膜SPEM细胞异常增殖和分化。

关键词： SQQT 胃黏膜炎-癌转化解痉多肽表达化生疗效观察系统生物学

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非酒精性脂肪性肝病的系统生物学研究

中西医结合肝病杂志 2024年第1期34卷 85-88页

作者：刘希敏吴华南京中医药大学附属常州市中医医院治未病科江苏常州213003 南京中医药大学

非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)已成为我国最常见的慢性肝病,全球约有25%的成年人患有NAFLD[1],是肝脏相关疾病发病率和死亡率的最突出原因之一[2]。非酒精性脂肪性肝炎(NASH)是NAFLD中最严重的一种,其特征是甘油三酯(脂肪变性)的过度积累... 详细信息

非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)已成为我国最常见的慢性肝病,全球约有25%的成年人患有NAFLD[1],是肝脏相关疾病发病率和死亡率的最突出原因之一[2]。非酒精性脂肪性肝炎(NASH)是NAFLD中最严重的一种,其特征是甘油三酯(脂肪变性)的过度积累、炎症损伤和肝细胞凋亡,可能进展至肝硬化和肝癌[3]。

关键词：非酒精性脂肪性肝病非酒精性脂肪性肝炎系统生物学组学

系统生物学在计算机辅助药物设计领域的应用与发展

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中国中药杂志 2023年第11期48卷 2868-2875页

作者：王雨晴胡孔法胡晨骏南京中医药大学人工智能与信息技术学院江苏南京210023 中国科学院上海药物研究所上海201210

随着医学的进步,人们对疾病复杂的发病机制有了更深的了解,从整体视角揭示药物的作用机制和治疗效果已成为目前药物设计的重中之重,而传统的药物设计方法已无法满足当前的形势和需求。近年来,系统生物学的飞跃发展使得包括代谢组学、基... 详细信息

随着医学的进步,人们对疾病复杂的发病机制有了更深的了解,从整体视角揭示药物的作用机制和治疗效果已成为目前药物设计的重中之重,而传统的药物设计方法已无法满足当前的形势和需求。近年来,系统生物学的飞跃发展使得包括代谢组学、基因组学、蛋白组学在内的多项新技术被广泛运用于药物研发。作为连接传统制药理论和现代科学的桥梁,计算机辅助药物设计的引入能够加快新药研究与设计的进程,缩短药物研发周期,提高药物研发的成功率。系统生物学和计算机辅助药物设计技术的应用为从整体视角揭示药物的作用机制提供了方法基础和前进方向。该文从多个角度介绍了系统生物学在计算机辅助药物设计方面的研究现状和应用,并提出系统生物学在计算机辅助药物设计领域中可预见的未来发展方向,为推动系统生物学在计算机辅助药物设计领域的应用提供了参考和思考。

关键词：系统生物学计算机辅助药物设计药物研发研究趋势

系统生物学技术在骨质疏松症研究中的应用进展

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中国骨质疏松杂志 2022年第5期28卷 766-769页

作者：王高祥楚淑芳寇鑫晖卢赵琦曾霖黄倩曾华李惠林南京中医药大学附属深圳市中医院广东深圳518000 深圳市中医院广东深圳518000 广州中医药大学第四临床医学院广东深圳518000

系统生物学作为一种整合医学,可以从整体出发,阐明生物体复杂的生理病理状态,主要包括:基因组学、蛋白质组学、转录组学、代谢组学和网络药理学等。骨质疏松症具有骨折风险高、骨强度降低、骨微结构恶化等特点,其导致的脆性骨折是老年... 详细信息

系统生物学作为一种整合医学,可以从整体出发,阐明生物体复杂的生理病理状态,主要包括:基因组学、蛋白质组学、转录组学、代谢组学和网络药理学等。骨质疏松症具有骨折风险高、骨强度降低、骨微结构恶化等特点,其导致的脆性骨折是老年人致残、致死的主要原因之一,系统生物学整体分析的特性与骨质疏松症全身性代谢疾病的特点从某种程度上讲有共通之处。近些年,系统生物学所包含的各组学技术已被应用于骨质疏松症的研究工作中,展现出独特优势。本文就近几年系统生物学技术在骨质疏松症研究中的应用进展作相关综述,旨在为系统生物学技术在骨质疏松症研究过程中的进一步应用提供依据。

关键词：骨质疏松症系统生物学整合医学

系统生物学方法在恶性肿瘤中医证候研究中的应用进展

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中华中医药杂志 2023年第6期38卷 2747-2750页

作者：张若琪孙哲拯王宝泉臧晓彤张培彤中国中医科学院广安门医院北京100053 北京中医药大学北京100029

中医药在综合治疗恶性肿瘤方面效果肯定,辨证论治是取得疗效的关键。由于中医辨证较多依赖主观经验而客观标准模糊,中医现代研究的科学性和辨证施治的准确性一直存在争议。系统生物学能够借助高通量测序技术从系统层面探讨复杂问题,有... 详细信息

中医药在综合治疗恶性肿瘤方面效果肯定,辨证论治是取得疗效的关键。由于中医辨证较多依赖主观经验而客观标准模糊,中医现代研究的科学性和辨证施治的准确性一直存在争议。系统生物学能够借助高通量测序技术从系统层面探讨复杂问题,有助于理解中医证候的本质。文章总结了恶性肿瘤中医证候在基因、蛋白质和代谢组水平的生物学基础,梳理了目前研究取得的成果和存在的不足,以期为组学模式下的恶性肿瘤中医证候研究提供思路与方法。

关键词：系统生物学恶性肿瘤中医证候客观化

系统生物学方法在中药品质形成机制研究中的应用

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中药材 2023年第7期46卷 1823-1828页

作者：林谷音冯煦陈雨南京中医药大学江苏南京210023 江苏省中国科学院植物研究所/江苏省植物资源研究与利用重点实验室江苏南京210014 江苏省中国科学院植物研究所/江苏省中药材生态种植与高值化利用工程研究中心江苏南京210014

中药品质是药用植物在其生长发育和对环境的适应过程中逐渐形成的,主要包括中药遗传品质与中药生态品质。中药的品质决定了中药活性成分的开发与中药资源的合理利用,是中药临床应用效果的保证,因而中药品质形成机制亟待阐明。系统生物... 详细信息

中药品质是药用植物在其生长发育和对环境的适应过程中逐渐形成的,主要包括中药遗传品质与中药生态品质。中药的品质决定了中药活性成分的开发与中药资源的合理利用,是中药临床应用效果的保证,因而中药品质形成机制亟待阐明。系统生物学这门新兴学科通过多组学研究的方法,可将基因组学、转录组学、蛋白组学和代谢组学方法得到的高通量数据进行系统的生物信息学分析和数据处理,为中药品质形成机制研究带来新的机遇。本文综述了近年来系统生物学的一些前沿方法,以及在中药品质形成机制研究中的相关研究进展,概述了系统生物学方法在中药品质形成机制中的研究现状,同时总结了在中药遗传品质、中药生态品质研究中的系统生物学“整体观”研究思路,为今后中药品质形成机制的解析提供“整体观”的研究思路与技术方法。

关键词：中药品质形成机制系统生物学多组学联用

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系统生物学

生物学杂志 2004年第3期21卷 8-11页

作者：许树成阜阳师范学院生物系安徽阜阳236032

分析了生命复杂性问题的产生及其由来,从复杂性问题研究的角度对系统科学与系统生物学的含义及其相互关系进行了深入的讨论。

关键词：系统科学系统生物学复杂性

中药四性的本草源流、药理学及系统生物学研究进展

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中药药理与临床 2023年

作者：郭晶晶李硕杨志军杨秀娟段国建田一虹魏江霞李越峰西北中藏药省部共建协同创新中心甘肃中医药大学陇药产业创新研究院

中药四性是传统中医药的基本理论之一，是历代医家在长期实践中经过反复验证得到的临床经验，对于指导临床用药具有重要的作用。近年来，从基础实验角度对中药四性的物质基础及作用机理进行了深入研究，因此通过古籍本草结合文献研究近... 详细信息

中药四性是传统中医药的基本理论之一，是历代医家在长期实践中经过反复验证得到的临床经验，对于指导临床用药具有重要的作用。近年来，从基础实验角度对中药四性的物质基础及作用机理进行了深入研究，因此通过古籍本草结合文献研究近况，以中药四性的起源、演变、现代药理学研究为主线，对中药四性的本草源流、动物实验、细胞实验及应用网络药理学及组学技术方法的系统生物学研究进行了全面的阐述，为中药四性的进一步实验研究和临床应用提供参考依据。

关键词：中药四性本草源流动物实验细胞实验系统生物学