厄洛替尼耐药的非小细胞肺癌细胞的差异表达mRNAs和lncRNAs分析

作     者：李树斌 于鸿 张耿月 Li Shubin;Yu Hong;Zhang Gengyue

作者机构：中国中医科学院广安门医院南区内一科北京102600 吉林省肿瘤医院吉林省肿瘤防治研究所细胞生物研究室长春130012 

出 版 物：《中华肺部疾病杂志（电子版）》 (Chinese Journal of Lung Diseases(Electronic Edition))

年 卷 期：2020年第13卷第3期

页      面：365-370页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：吉林省卫生技术创新项目(2017J025)。 

主　　题：非小细胞肺癌 厄洛替尼耐药 差异表达 IncRNAs分析 

摘      要：目的筛选并分析厄洛替尼耐药的非小细胞肺癌细胞的差异表达mRNAs和lncRNAs。方法在Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中挑选数据集GSE80344,其数据来自厄洛替尼耐药的HCC827细胞和敏感细胞。通过GEO2R和探针匹配分析差异表达mRNAs和lncRNAs,筛选标准为|Fold change|1.5,P value0.01。通过Panther(http://***)、KEGG(http://www.***.jp/)、STRING(http://***)等数据库分析筛选得到的差异表达mRNAs和lncRNAs的可能的作用机制。通过TCGA(https://cancergenome.***.gov/)数据库对筛选得到的关键mRNAs和lncRNAs进行生存分析验证。结果厄洛替尼耐药的HCC827细胞和敏感细胞相比,差异表达mRNAs共644个,差异表达lncRNAs共367个,其中128 mRNAs表达上调,516 mRNAs表达下调;137 lncRNAs表达上调,230 lncRNAs表达下调。这些mRNAs和lncRNAs主要涉及在PI3K-Akt、Ras、MAPK、ECM受体相互作用等与癌症密切相关的信号通路中发挥作用。基于数据库的分析验证结果与筛选结果一致。结论筛选分析得到的关健mRNAs和lncRNAs可为深入研究非小细胞肺癌EGFR-TKIs耐药机制的前期实验依据。