人健康肝组织核心岩藻糖基化蛋白质的鉴定及生物信息学分析

作     者：代智 樊嘉 周俭 柏斗胜 邱双健 康晓楠 崔杰峰 郭坤 李岩 刘银坤 DAI Zhi;FAN Jia;ZHOU Jian;BAI Dou-Sheng;QIU Shuang-Jian;KANG Xiao-Nan;CUI Jie-Feng;GUO Kun;Li Yan;LIU Yin-Kun

作者机构：复旦大学附属中山医院肝癌研究所教育部癌变和侵袭原理重点实验室上海200032 复旦大学生物医学研究院上海200032 

出 版 物：《生物化学与生物物理进展》 (Progress In Biochemistry and Biophysics)

年 卷 期：2008年第35卷第5期

页      面：555-562页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 071010[理学-生物化学与分子生物学] 081704[工学-应用化学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-化学工程与技术] 10[医学] 

基　　金：国家高技术研究发展计划资助项目(863)(2007AA02Z479) 上海市医学领军人才资助项目(LJ06004) 高等学校博士学科点专项科研基金资助项目(20070246112) 复旦大学青年科学基金资助项目(EYF152008)~~ 

主　　题：核心岩藻糖蛋白 扁豆凝集素 亲和层析 糖蛋白质组学 人健康肝组织 

摘      要：糖蛋白质组学方法鉴定人健康肝组织核心岩藻糖基化蛋白质,将有助于发现肝癌、慢性肝病相关异常核心岩藻糖基化蛋白质.应用凝集素亲和层析技术、双向电泳(2-DE)联合基质辅助激光解吸飞行时间串联质谱(MALDI-TOF-MS/MS)分析,建立人健康肝组织核心岩藻糖基化蛋白表达谱,图谱均点数为(130±3)个,挖取90个蛋白质点进行质谱鉴定,数据库搜索及去冗余后,共鉴定53种蛋白质,主要分布于pI5～9,分子质量为10～100ku区域处.Gene Ontology分类发现它们参与体内代谢等过程,应用NetNGlyc对它们进行糖基化位点预测,并通过蛋白质免疫沉淀联合凝集素亲和印迹对其中的结合珠蛋白前体,α烯醇化酶的核心岩藻糖基化进行了再验证.以上结果提示,凝集素层析、2-DE联合MALDI-TOF-MS/MS分析是一种鉴定某种特定类型糖蛋白的高通量检测方法,所建立的表达谱可用于发现疾病发生、发展中相关的异常核心岩藻糖基化蛋白质.