基于网络药理学和分子对接分析薤白治疗心肌缺血再灌注损伤的作用机制
Study on the mechanism of Allium macrostemon Bunge for treatment of myocardial ischemia-reperfusion injury via network pharmacology and molecular docking作者机构:贵州中医药大学基础医学院贵州贵阳550025 贵州中医药大学实验中心贵州贵阳550025
出 版 物:《中国医院药学杂志》 (Chinese Journal of Hospital Pharmacy)
年 卷 期:2020年第40卷第8期
页 面:885-891页
学科分类:1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 100706[医学-药理学] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学]
基 金:国家自然科学基金地区科学基金项目(编号:81860873) 贵州省科技厅科技计划项目(黔科合基础1401和黔科合LH字7120号) 贵州省教育厅青年科技人才成长项目(黔教合KY字186) 贵阳中医学院2017年度学术新苗培养及创新探索专项项目(黔科合平台人才5735号-06)
主 题:薤白 心肌缺血再灌注损伤 网络药理学 分子对接 信号通路
摘 要:目的:基于网络药理学方法探讨薤白治疗心肌缺血再灌注损伤的作用机制。方法:在中药系统药理学分析平台(TCMSP)上检索和筛选薤白的活性成分、作用靶点;利用OMIM数据库和CTD数据库搜集疾病靶点;找出薤白作用靶点和疾病靶点共有交集靶点,分子对接软件SYBYL验证薤白活性成分与交集靶点结合活性。然后利用String数据库和Cytoscape软件绘制靶点蛋白互作网络,利用DAVID数据库对靶点进行信号通路富集分析,利用Cytoscape软件构建薤白活性成分-靶点-信号通路网络。结果:筛选获得薤白活性成分10个,治疗疾病作用靶点19个。蛋白互作分析结果显示,17个靶点蛋白存在相互作用关系,IL6、TNF、NOS3、CCL2、VEGFA、SOD1、CAT与10个及以上蛋白存在互作关系。信号通路富集结果显示,上述靶点主要与流体剪切应力与动脉粥样硬化、过氧化物酶体、HIF-1信号通路、松弛素信号通路、细胞因子-细胞因子-受体相互作用、IL-17信号通路以及肿瘤坏死因子信号通路等23条信号通路有关。结论:薤白通过多成分、多靶点、多途径治疗心肌缺血再灌注损伤,其作用机制主要通过调控流体剪切应力、氧化应激及炎性反应来发挥作用。