基于生物信息学探讨骨质疏松症与2型糖尿病的关系
Investigating the relationship between osteoporosis and type 2 diabetes mellitus based on bioinformatics作者机构:山东中医药大学山东济南250355
出 版 物:《中国骨质疏松杂志》 (Chinese Journal of Osteoporosis)
年 卷 期:2020年第26卷第4期
页 面:469-473页
核心收录:
学科分类:1002[医学-临床医学] 100210[医学-外科学(含:普外、骨外、泌尿外、胸心外、神外、整形、烧伤、野战外)] 100201[医学-内科学(含:心血管病、血液病、呼吸系病、消化系病、内分泌与代谢病、肾病、风湿病、传染病)] 10[医学]
主 题:生物信息学 骨质疏松症 2型糖尿病 分子机制 疾病相互关系
摘 要:目的基于生物信息学探讨骨质疏松症与2型糖尿病的关系。方法通过五大疾病数据库(Disgenet、TTD、OMIM、Drugbank、KEGG数据库)和分析平台(DAVID数据库)对骨质疏松症和2型糖尿病的相关基因进行分析筛选,并对筛选结果进行基因富集分析以及KEGG通路分析。结果通过五大疾病数据库及相关文献筛选分别选出与骨质疏松症和2型糖尿病相关基因336个和316个,并将数据导入DAVID数据库进行基因富集分析以及KEGG通路分析,结果骨质疏松症与2型糖尿病相关通路集中在PI3K-Akt信号通路、FoxO信号通路、HIF-1信号通路、AMPK信号通路、Rap1信号通路、Jak-STAT信号通路、Ras信号通路、NF-kappa B信号通路、T细胞信号通路、TNF信号通路、VEGF信号通路、脂肪细胞因子信号通路、fc-εri信号通路。结论骨质疏松症与2型糖尿病均是涵盖众多差异表达基因的复杂代谢性疾病,两种疾病均存在庞大的基因表达网络,涉及众多信号通路。从通路分析结果中可以看出,两种疾病复杂基因网络背景下依然存在一些高度重合的差异基因表达,所涉及的信号通路能够同时对两种疾病产生调控作用,这提示两种疾病分子机制存在密切关联,并可能是药物同时干预两种疾病的靶点所在。