棉花新材料A111基于cpDNA的种性初步鉴定

作     者：冯坤 刘方 蔡小彦 黎绍惠 周忠丽 张先亮 华金平 王坤波 

作者机构：中国农业科学院棉花研究所棉花生物学国家重点实验室河南安阳455000 开封市农林科学研究院河南开封475141 中国农业大学农学与生物技术学院杂种优势研究与利用教育部重点实验室作物遗传改良北京市重点实验室北京100193 

出 版 物：《中国农业科技导报》 (Journal of Agricultural Science and Technology)

年 卷 期：2013年第15卷第1期

页      面：55-64页

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：国家973计划项目(2010CB126006) 国家863计划项目(2011AA10A102) 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2012ZL037)资助 

主　　题：A111 cpDNA 棉属 物种鉴定 

摘      要：A111是从澳大利亚收集到的一份新的野生棉,属于澳洲棉、或奈尔逊氏棉乃至一个新的棉种,归属一直没定论。为鉴别A111与澳大利亚以及世界其它地区棉种的差别,以24个棉种(变种)为参照,分析了A111的cpDNA序列特点。结果表明,在15条cpDNA基本序列中,筛选出了8条序列适合于棉属植物系统发育和种性鉴别研究。这8条序列的变异率和识别率均较高,其中rps16识别率最高(100%)。基于8个序列组合的系统发育分析,能识别单个棉种。聚类结果显示,棉属分为两大分支,A111与奈尔逊氏棉(G3)处于澳洲野生棉分支中的姊妹分支。序列比对结果表明,A111的叶绿体序列存在特异的插入与缺失,明显区别于其他棉种。由此,初步鉴定A111是澳洲野生棉的一个新种,与奈尔逊氏棉的亲缘关系最近。