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Streptomyces bacillaris ATCC 15855~T中bafilomycin A1合成基因簇的挖掘

Mining bafilomycin A1 gene cluster based on Streptomyces bacillaris ATCC 15855T genomic information

作     者:赵守静 高坤鹏 刘振 毛相朝 ZHAO Shoujing;GAO Kunpeng;LIU Zhen;MAO Xiangzhao

作者机构:中国海洋大学食品科学与工程学院青岛266003 青岛海洋科学与技术国家实验室海洋药物与生物制品功能实验室青岛266237 

出 版 物:《工业微生物》 (Industrial Microbiology)

年 卷 期:2019年第49卷第6期

页      面:18-25页

学科分类:0710[理学-生物学] 1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 07[理学] 071005[理学-微生物学] 10[医学] 

基  金:泰山学者青年专家计划 

主  题:Streptomyces bacillaris ATCC 15855^T 全基因组序列 Bafilomycin A1 次级代谢产物 基因簇 

摘      要:Bafilomycin A1是大环内酯类抗生素,具有广泛的抗癌活性。通过HPLC及HPLC-MS分析Streptomyces bacillaris ATCC 15855^T的发酵产物,结果显示*** ATCC 15855 T发酵能够产生bafilomycin A1。*** ATCC 15855^T分离自中亚土壤。通过全基因组测序,获得了*** ATCC 15855^T的完整基因组序列。该基因组由6957417 bp的线性染色体组成,GC含量为72.29%。该染色体预测了7284个开放阅读框架(ORF),18个rRNA操纵子,64个tRNA基因。通过antiSMASH v 4.0.3分析,共预测了39个生物合成基因簇。其中,具有抑制液泡型H(+)ATP酶的bafilomycin A1基因簇与已报道的基因簇相似度为100%。在bafilomycin A1合成基因簇中有19个ORFs。

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