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基于SQL Server的蛋白质二级结构预测样本集数据库的构建

Constitution of database on data sets for prediction of protein secondary structures based on SQL server

作     者:张宁 吴捷 宋卓 张涛 Zhang Ning;Wu Jie;Song Zhuo;Zhang Tao

作者机构:南开大学生命科学学院生物活性材料教育部重点实验室天津300071 

出 版 物:《高技术通讯》 (Chinese High Technology Letters)

年 卷 期:2006年第16卷第6期

页      面:619-623页

核心收录:

学科分类:0710[理学-生物学] 071010[理学-生物化学与分子生物学] 081704[工学-应用化学] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-化学工程与技术] 

基  金:国家自然科学基金(30370386 30470453)助项目 

主  题:数据库 蛋白质二级结构预测 样本集 SQL Server 生物信息学 

摘      要:基于SQL Server数据库管理系统,将蛋白质二级结构预测的样本集CB513、CB396和RS126组织起来,建立了数据库DataSet,并配置了一个IIS服务器以方便网络查询。该数据库将蛋白质二级结构预测样本集有效地组织起来,实现了规范化、结构化统一管理,便于存储、检索和分析数据,减少错误的发生。通过该数据库可以提取供蛋白质二级结构预测研究的样本、序列转换、变换编码以及分析评价预测结果等,取代许多传统编程处理文本文件的繁琐工作,大大提高效率,促进工作的开展。

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