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基于Cyt b基因探讨羚羊亚科原羚属系统发生关系

Molecular Phylogenetic Relationships for Procapra in Antilopinae(Artiodactyla,Bovidae) Based on Sequence of Mitochondrial Cytochrome b Gene

作     者:王江 方盛国 WANG Jiang;FANG Shengguo

作者机构:浙江大学生命科学学院 

出 版 物:《兽类学报》 (Acta Theriologica Sinica)

年 卷 期:2005年第25卷第2期

页      面:105-114页

核心收录:

学科分类:0710[理学-生物学] 07[理学] 0905[农学-畜牧学] 0906[农学-兽医学] 071002[理学-动物学] 

基  金:国家林业局濒危野生动物基因资源收集专项资助 

主  题:羚羊亚科 系统发生关系 细胞色素b基因 Cyt 序列差异 分歧时间 系统进化树 藏原羚 分类地位 同源序列 碱基组成 赛加羚羊 全序列 黄羊 核苷酸 未饱和 分子钟 并系 物种 牛科 突变 单系 

摘      要:原羚属物种在羚羊亚科中的分类地位尚存在很多争议。本文测定了原羚属的黄羊和藏原羚细胞色素b基因全序列(114 0bp) ,并与牛科其它属31个种的同源序列进行比较,对其碱基组成变异情况及核苷酸序列差异进行了分析。基于细胞色素b基因全序列,用简约法(MP)、邻接法(NJ)和似然法(ML)构建了系统进化树。结果表明:黄羊和藏原羚的序列差异为3 78% ,颠换数目近乎为0 ,其突变远未饱和;原羚属内黄羊和藏原羚为不同种,单系发生;原羚属与赛加羚羊属、犬羚属及跳羚属等并系发生,原羚属隶属于羚羊亚科,应为独立属;羚羊亚科组成属间多为并系起源。根据序列差异值2 % /百万年的细胞色素b分子钟,推测黄羊和藏原羚分歧时间大约为1~2百万年;原羚属与羚羊亚科其它属分歧时间大约在5

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