猪圆环病毒2型HBZX株的全基因组克隆及序列分析

作     者：温国元 罗青平 杨峻 李坤 商雨 张蓉蓉 罗玲 王红琳 艾地云 邵华斌 WEN Guo-yuan;LUO Qing-ping;YANG Jun;LI Kun;SHANG Yu;ZHANG Rong-rong;LUO Ling;WANG Hong-lin;AI Di-yun;SHAO Hua-bin

作者机构：湖北省农业科学院畜牧兽医研究所武汉430209 

出 版 物：《湖北农业科学》 (Hubei Agricultural Sciences)

年 卷 期：2008年第47卷第10期

页      面：1117-1121页

学科分类：090603[农学-临床兽医学] 090601[农学-基础兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 

基　　金：湖北省科技攻关项目(2007AA402C55) 

主　　题：猪圆环病毒2型 基因组克隆 同源性 进化树 

摘      要：参照GenBank发表的猪圆环病毒2型(Porcine Circovirus type 2,PCV2)序列,设计合成了1对用于扩增PCV2全长基因组的特异性引物,从患断奶后仔猪多系统衰弱综合征(PMWS)的病料中,采用PCR方法克隆了PCV2 HBZX株的全长基因组序列,并进行了序列测定与分析。结果显示,PCV2 HBZX株的基因组全长为1 767nt;同源性比较发现,HBZX株与其他PCV2株的核苷酸同源性为95.0%～98.9%;遗传进化树分析表明,根据PCV2全基因组序列和ORF2编码蛋白的氨基酸序列所绘制的遗传进化树相似度较高;PCV2可分为两个亚型,以中国株为代表的亚洲株和以加拿大株为代表的美洲株分布在亚型1中,以法国株为代表的欧洲株分布在亚型2中。说明PCV2各分离株之间存在较为明显的地理位置上的相关性。