一种提高固定pH梯度(IPG)凝胶双向电泳的重复性、分辨率和通量的方法(英文)

作     者：袁泉 安杰 刘定干 赵辅昆 YUAN Quan, AN Jie, LIU Ding Gan, ZHAO Fu Kun * ( Key Laboratory of Proteomics, Institute of Biochemistry and Cell Biology, Shanghai Institutes for Biological Sciences, the Chinese Academy of Sciences, Shanghai 200031, China )

作者机构：中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所蛋白质组学重点实验室 中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所蛋白质组学重点实验室 上海200031 

出 版 物：《生物化学与生物物理学报》 (Acta Biochimica Et Biophysica Sinica)

年 卷 期：2003年第35卷第7期

页      面：611-618页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 071010[理学-生物化学与分子生物学] 081704[工学-应用化学] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-化学工程与技术] 

基　　金：国家自然科学基金资助项目(No .3 9990 60 0) 中国科学院基金资助项目 (No.KSCX 2 2 0 6) 上海市科发基金资助项目 (No .ODJC14 0 18) 

主　　题：双向电泳 同时进行多块固定pH梯度(IPG)凝胶的方法 重复性 高通量 蛋白质组学 

摘      要：在蛋白质组学研究中 ,双向聚丙烯酰胺凝胶电泳是现行蛋白质分离的最重要的方法之一。实验发展了一种提高固定pH梯度 (IPG)凝胶双向电泳的重复性、分辨率和通量的方法 :在一块SDS 聚丙烯酰胺凝胶上同时进行多块固定pH梯度(IPG)凝胶 (Multi stripsononeSDSgel,MSOG)电泳。用此方法比较了人肝癌细胞、不同生长状态的人肝癌细胞、3T3细胞的蛋白质以及同一个样品在不同大小的第二向凝胶系统 (大型和中型凝胶 )的双向电泳图谱。结果表明 ,同一样品在 13cmIPGStrip双向电泳可分离 2 0 0 0以上蛋白质点且图谱蛋白质点的匹配率可超过 95 %以上。同时又可以最大程度地降低凝胶背景对蛋白质点比较分析的干扰 ,从而提高了双向电泳分离蛋白质的分辨率和通量。这些优点都有助于差异蛋白质组学特别是细胞器差异蛋白质组学研究的自动化。