人副流感病毒广州分离株ZYMgz01全基因组序列测定及分析

作     者：陈翊 曾华 钟家禹 林涛 朱冰 周荣 CHEN Yi;ZENG Hua;ZHONG Jia-yu;LIN Tao;ZHU Bing;ZHOU Rong

作者机构：广州市妇女儿童医疗中心广东广州510120 中山大学孙逸仙纪念医院广东广州510120 

出 版 物：《热带医学杂志》 (Journal of Tropical Medicine)

年 卷 期：2011年第11卷第8期

页      面：879-881,904页

学科分类：1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 100401[医学-流行病与卫生统计学] 10[医学] 

基　　金：广州市卫生科技一般引导项目(2009-YB-214) 

主　　题：人副流感病毒 HN基因 同源性 基因组 

摘      要：目的探讨广州地区副流感病毒的基因组结构和基因型。方法参照GenBank副流感病毒(U51116)全基因组序列设计11对引物,覆盖副流感病毒基因组的全长。以副流感病毒cDNA为模板分段扩增病毒基因组的全长,各片段克隆到T载体上,并进行序列测定和分析。结果人副流感病毒ZYMgz01株全基因组核酸序列为15462bp,提交到GenBank的序列号为EU326526,与3型副流感病毒保守基因同源性为94.0%,具有3型副流感病毒的结构特征。基因组序列同源性比较结果显示,ZHYMgz01株病毒与兰州的LZ22(FJ455842)病毒株的同源性最高,为99.1%;与美国突变病毒株(U51116)同源性为95.1%;与美国病毒株(Z11575)同源性为95.2%;与日本(ABO12132)病毒株的同源性为94.8%,而与加拿大(EU424062)病毒株的同源性为94.8%。系统进化树显示ZHYMgz01病毒株与兰州的LZ22病毒株同属一个进化分支。结论广州地区儿童呼吸道感染的副流感病毒ZHYMgz01全基因组为15462bp,与3型副流感病毒的同源性最高,确定ZHYMgz01是3型副流感病毒。3型副流感病毒系统进化可能与地域差异有一定的关系。