大熊猫核糖体蛋白亚基RPS7基因的克隆及序列分析

作     者：侯怡铃 伍春莲 侯万儒 郝彦哲 张田 HOU Yi-ling;WU Chun-lian;HOU Wan-ru;HAO Yan-zhe;ZHANG Tian

作者机构：西华师范大学生命科学学院四川南充637002 

出 版 物：《第三军医大学学报》 (Journal of Third Military Medical University)

年 卷 期：2009年第31卷第18期

页      面：1740-1743页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 071010[理学-生物化学与分子生物学] 081704[工学-应用化学] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-化学工程与技术] 071007[理学-遗传学] 

基　　金：国家自然科学基金(30470261) 四川省应用技术项目(2006J13-057) 四川省教育厅重点科研项目(07ZA120) 四川省重点学科动物学建设资助项目(404001) 四川省科技厅应用基础项目(2009JY0061)~~ 

主　　题：大熊猫 RT—PCR RPS7 克隆 序列分析 

摘      要：目的了解大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)核糖体蛋白亚基RPS7基因的结构及其与已报道的人和其他哺乳动物核糖体蛋白亚基RPS7基因的同源性。方法运用RT-PCR技术,从大熊猫的肌肉组织总RNA中对核糖体蛋白亚基RPS7基因的表达序列进行克隆、测序;采用Gnescan软件,对所克隆的基因序列进行氨基酸序列推定;采用ORF finder软件进行DNA序列的开放阅读框(ORF)查找;采用DNAMAN Version6,对基因序列和氨基酸序列进行同源性比较;采用Ex2PASy Proteomics Server软件进行蛋白质功能位点和生化特性预测分析。结果大熊猫RPS7基因的表达序列全长为589bp,ORF为585bp,编码194个氨基酸,该蛋白的相对分子质量为22.12685×103,等电点为10.09,含有1个N-糖基化位点,2个依赖于cAMP和cGMP的蛋白激酶磷酸化位点,4个蛋白激酶C磷酸化位点,1个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,2个十四(烷)酰化位点,2个酰胺化位点及1个RPS7蛋白signature位点。进一步分析结果显示,大熊猫RPS7基因的表达序列及其编码的氨基酸序列与已报道的部分哺乳动物具有很高的相似性。结论运用分子生物学原理与相应的技术手段,成功地扩增出大熊猫RPS7基因的表达序列,并对其编码的蛋白进行了初步分析,丰富和完善了哺乳动物RPS7基因资料库。