中国小型猪SLA-DMA基因的SSCP分析

作     者：于辉 李波 李华 李彬 李学伟 刘为民 赵海全 YU Hui;LI Bo;LI Hua;LI Bin;LI Xue-wei;LIU Wei-min;ZHAO Hai-quan

作者机构：佛山科学技术学院生命科学学院佛山528231 四川农业大学动物科技学院雅安625014 

出 版 物：《畜牧兽医学报》 (ACTA VETERINARIA ET ZOOTECHNICA SINICA)

年 卷 期：2008年第39卷第10期

页      面：1300-1305页

核心收录：

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖] 

基　　金：国家自然科学基金(3030024630671500)资助项目 

主　　题：小型猪 SLA-DMA SSCP 方法学 多样性 

摘      要：通过对甘孜藏猪、合作猪、巴马猪以及五指山猪4个群体的SLA-DMA基因第2和第3外显子的PCR-SS-CP和序列多态分析表明:SLA-DMA基因的第2外显子没有多态,但第3外显子有2个等位基因的变异。通过优化低离子强度单链构象多态分型条件(LIS-PCR-SSCP)、克隆测序、菌落PCR、菌落不对称PCR及单链DNA二级结构计算机预测等技术,对第3外显子PCR-SSCP复杂带型进行了准确的判定,J等位基因的带型与单链DNA二级结构计算机预测结果之间存在很高的一致性。4群体中SLA-DMA基因的第3外显子共有JJ/JK/KK 3种基因型,均达到了Hardy-Weinberg平衡。其中K等位基因频率高于J等位基因频率。杂合度和多态信息含量的高低依次为:巴马猪、五指山猪、合作猪、甘孜藏猪。除甘孜藏猪多态信息含量为低度多态外,其余群体均为中度多态。