富民枳种质资源的SSR遗传多样性研究

作     者：张珊珊 甘云浩 杨文忠 段宗亮 丁红茜 康红梅 诺苏那玛 ZHANG Shan-shan;GAN Yun-hao;YANG Wen-zhong;DUAN Zong-liang;DING Hong-qian;KANG Hong-mei;NAMA Nuo-su

作者机构：云南省林业科学院云南昆明650201 国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201 昆明市濒危动植物收容拯救中心云南昆明650224 宾夕法尼亚州立大学理学院宾夕法尼亚斯泰特科利奇16563 

出 版 物：《西部林业科学》 (Journal of West China Forestry Science)

年 卷 期：2018年第47卷第4期

页      面：14-20,25页

学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(31460119和31660164) 科技基础资源调查专项(2017FY100102) 云南省林业科学院创新基金项目(QN2018-05) 

主　　题：极小种群植物 种质资源 遗传管理 SSR标记 富民枳 

摘      要：以野外已经灭绝的极小种群植物富民枳为对象,基于当前建立的种质资源收集圃开展群体遗传分析研究,探讨种质资源收集保存和野外回归的有效途径,为极小种群植物的拯救保护提供科学依据。利用毛细管电泳检测,从已发表的51个柑橘属SSR引物中,筛选出特异性高和多态性好的,对采集自10个种质资源收集地的170份富民枳样本进行遗传多样性分析,采用POPGENE、PIC_Calc、Populations、Fig Tree和Origin软件分别进行遗传参数估计、引物多态性信息含量计算、邻接树构建和聚类图的绘制。结果显示:SSR引物的多态性信息含量(PIC)平均为0.337 8;Shannon信息指数(I)平均为0.642 8;有效等位基因数(Ne)平均为1.798 7;Nei’s遗传多样性指数(Nei)平均为0.430 0;平均期望杂合度(He)为0.430 0;平均观测杂合度(Ho)为0.568 7。聚类分析显示,170个富民枳样本共聚类了65个分支末梢,属于同一个分支末梢的被默认为同等的遗传关系,我们称这65个样本为有效样本。综合评价结果表明:富民枳现存种质资源的遗传多样性水平较低,只有C2和C7在遗传水平上的保护是有效的,即有效样本量大于10,Shannon信息指数又达到该物种遗传多样性水平的90%以上。本研究结果为该物种有效的遗传管理奠定了理论基础。