牛源防御素类抗菌肽的生物信息学分析

作     者：张炜 杭柏林 董萌萌 胡斌 徐彦召 张慧辉 胡建和 Zhang Wei;Hang Bolin;Dong Mengmeng;Hu Bin;Xu Yanzhao;Zhang Huihui;Hu Jianhe

作者机构：河南科技学院动物科技学院河南新乡453003 

出 版 物：《现代畜牧兽医》 (Modern Journal of Animal Husbandry and Veterinary Medicine)

年 卷 期：2018年第7期

页      面：1-9页

学科分类：0710[理学-生物学] 071010[理学-生物化学与分子生物学] 081704[工学-应用化学] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-化学工程与技术] 

基　　金：国家自然科学基金项目(31672559) 河南省自然科学基金项目(182300410031) 河南省高校科技创新团队支持计划(15IRTSTHN) 河南科技学院高层次人才启动项目(2014020) 

主　　题：牛 防御素 抗菌肽 生物信息学 

摘      要：为研究牛源防御素类抗菌肽的生物学功能,本研究利用Prot Param工具分析了抗菌肽的理化性质,利用SOPMA分析了抗菌肽的二级结构,利用NetOGlyc 4.0 Server分析了抗菌肽的糖基化,利用NetPhos 3.1 Server分析了抗菌肽的磷酸化,利用Target P 1.1 Server分析了抗菌肽的亚细胞内定位。结果表明,牛源防御素类抗菌肽为阳离子型抗菌肽,等电点在9.31~11.20之间;TAP、bBD-1、BNBD2、BNBD3、BNBD7、BNBD8和BNBD9为稳定性多肽,其他牛源防御素类抗菌肽为不稳定多肽;BNBD12和BNBD13为疏水性多肽,其他牛源防御素类抗菌肽为亲水性多肽;TAP、LAP、b BD-1、BNBD2、BNBD3、BNBD4、BNBD6、BNBD7、BNBD8和BNBD10由α螺旋、β折叠、β转角和无规则卷曲构成,EBD、BNBD1、BNBD5、BNBD11、BNBD12和BNBD13由β折叠、β转角和无规则卷曲构成;没有糖基化位点,除了BNBD7不存在磷酸化位点外,其他16种防御素类抗菌肽存在丝氨酸和苏氨酸的磷酸化位点,但不存在酪氨酸的磷酸化位点。根据分析结果推测牛源防御素类抗菌肽可作用于细胞壁或细胞膜,从而导致细菌死亡。