在树突状细胞中筛选与呼吸道合胞病毒诱发哮喘相关的长链非编码RNAs

作     者：孙淑宁 乔建瓯 韩肇庆 SUN Shu - ning;QIAO Jian- ou;HAN Zhao- qing

作者机构：上海交通大学医学院附属第九人民医院呼吸内科上海200001 

出 版 物：《广东医学》 (Guangdong Medical Journal)

年 卷 期：2017年第38卷第21期

页      面：3229-3234页

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金资助项目(编号:81170028) 

主　　题：呼吸道合胞病毒 哮喘 树突状细胞 长链非编码RNA 

摘      要：目的使用人类全转录组芯片检测呼吸道合胞病毒(RSV)诱发哮喘中的树突状细胞(DCs),以筛选差异表达的长链非编码RNAs(lncRNAs)。在lncRNAs转录调控层面研究RSV诱发哮喘的机制。方法设立HDC-BEAS+RSV组、HDC-RSV组和HDC-CONTROL组3组,其中HDC-BEAS+RSV组是将RSV感染的人支气管上皮细胞BEAS-2B和未成熟DCs通过Transwell共培养,HDC-RSV组是将RSV感染未成熟DCs,HDCCONTROL组是将RSV对照液感染未成熟DCs。使用affymatrix的HTA2.0芯片检测3组DCs中基因和lncRNAs的表达差异,并对其进行聚类分析、GO分析和Pathway分析。结果筛选出有差异表达的25个基因和29个lncRNAs,其中20个基因表达上调,5个基因表达下调,27个lncRNAs表达上调,2个lncRNAs表达下调。上调的基因主要涉及促炎免疫反应,例如信号转导、趋化因子信号传导途径、细胞因子受体相互作用等。结论我们筛选出了RSV诱发哮喘中差异表达的lncRNAs,为进一步在lncRNA转录调控层面研究RSV诱发哮喘的机制奠定基础。