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巢式聚合酶链反应结合Real-time聚合酶链反应用于检测百日咳鲍特菌方法建立及应用

Application of nested polymerase chain reaction combined with real-time polymerase chain reaction for diagnosis of Bordetella pertussis

作     者:聂丹文 聂富 高源 朱兵清 徐丽 李月 张秋莹 邵祝军 

作者机构:中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室北京102206 随州市疾病预防控制中心湖北随州441300 随县疾病预防控制中心湖北随县441304 随州市中心医院湖北随州441300 

出 版 物:《中国疫苗和免疫》 (Chinese Journal of Vaccines and Immunization)

年 卷 期:2017年第23卷第2期

页      面:177-181页

学科分类:1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 100401[医学-流行病与卫生统计学] 10[医学] 

主  题:巢式聚合酶链反应 Real-time聚合酶链反应 百日咳 

摘      要:目的建立一种具有高敏感性、高特异性的百日咳鲍特菌聚合酶链反应(Polymerase chain reaction,PCR)检测方法。方法以百日咳鲍特菌插入序列IS481为目的基因,通过Primer5.0软件设计巢式PCR(Nested PCR,nPCR)外引物,并优化扩增条件和程序,结合IS481目的基因的检测方法,建立nPCR结合Real-time PCR(rPCR)检测百日咳鲍特菌的方法,应用于354份流感样病例标本核酸检测和34份临床疑似百日咳病例标本核酸检测。结果该结合检测方法的最低检出限为0.225 copies/μL,能同时检测百日咳鲍特菌和霍氏鲍特菌,其他参考菌株均呈阴性,具有较好的特异性,进一步通过rPCR区分霍氏鲍特菌。采用该结合检测技术,354份流感样病例核酸标本中17份百日咳鲍特菌阳性,34份临床疑似百日咳病例核酸标本中12份百日咳鲍特菌阳性,而单独针对百日咳鲍特菌的rPCR方法分别仅检测出1份和6份阳性,rPCR检出的阳性标本,本方法均可检出。结论基于IS481基因的nPCR结合rPCR方法可用于百日咳鲍特菌的检测,具有较高的敏感性和特异性特点。

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