甘肃省鼠疫菌株差异区段基因分型及其流行病学特征

作     者：郭丽民 张宏 吴斌 苗克军 徐大琴 葛亚俊 席进孝 GUO Li-min;ZHANG Hong;WU Bin;MIAO Ke-jun;XU Da-qin;GE Ya-jun;XI Jin-xiao

作者机构：甘肃省疾病预防控制中心甘肃兰州730020 

出 版 物：《中国地方病防治》 (Chinese Journal of Control of Endemic Diseases)

年 卷 期：2016年第31卷第8期

页      面：862-863页

学科分类：1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 100401[医学-流行病与卫生统计学] 10[医学] 

基　　金：国家卫生行业科研专项(201202012) 甘肃省卫生行业计划项目(gswst09-14) 甘肃省卫生行业管理项目(GWGL2010-33) 

主　　题：鼠疫菌 差异区段 基因分型 流行病学 

摘      要：目的研究甘肃省鼠疫菌差异区段基因分型及其流行特征。方法根据鼠疫菌基因组的23个差异区段(DFR)对202株鼠疫菌进行基因分型,并进行聚类分析。结果 202株鼠疫菌分为8个基因型,即1b型、5型、7型、8型、13型、26型及新发现的GS1型和GS2型。9株黄鼠型菌株被分为13型和26型。18株阿尔金型菌株被分为3个型,其中1株为GS2型,6株为8型,11株为1b型。48株祁连型被分为3个型,其中5株为8型,39株为GS1型,4株为GS2型。127株青藏型菌株被分为6个型,其中1株为5型,6株为7型,56株为8型,39株为1b型,20株为GS1型,5株为GS2型。黄鼠型鼠疫菌的主基因型为26型,阿尔金型鼠疫菌的主基因型为1b型,祁连型鼠疫菌的主基因型为GS1型,青藏型鼠疫菌的主基因型为8型。结论 GS1和GS2为新发现的2个新基因型。黄鼠型鼠疫菌株同阿尔金型、祁连型和青藏型菌株基因型相似度较小,阿尔金型、祁连型和青藏型基因型相似度较大。