猪羰基还原酶1(CBR1)基因克隆及组织表达谱分析

作     者：张爱玲 孙显月 尹琪 李加琪 张豪 ZHANG Ai-ling;SUN Xian-yue;YIN Qi;LI Jia-qi;ZHANG Hao

作者机构：广东第二师范学院生物与食品工程学院/广东高校应用生态工程技术开发中心广东广州510303 华南农业大学动物科学学院/广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室广东广州510642 广东温氏食品集团股份有限公司广东云浮527400 

出 版 物：《广东农业科学》 (Guangdong Agricultural Sciences)

年 卷 期：2016年第43卷第8期

页      面：151-157页

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 08[工学] 0905[农学-畜牧学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：国家自然科学基金(31201771) 国家科技支撑计划项目(2011BAD28B01) 国家现代农业产业技术体系专项(CARS-36) 

主　　题：猪 CBR1 基因表达 启动子 

摘      要：为了深入研究猪羰基还原酶1(CBR1)基因的表达调控,通过PCR获得包括猪CBR1基因启动子和外显子、内含子的序列,并进行蛋白结构分析和系统进化关系比较,通过RT-PCR方法检测了CBR1基因在不同组织的表达丰度。结果表明,猪CBR1基因启动子区长度为2 875 bp,具有潜在典型的NFκB等转录因子结合位点;CBR1基因由3个外显子和2个内含子组成,外显子长度分别为289、108和437 bp,其中5′UTR和3′UTR分别为107 bp和242 bp,内含子长度分别为572 bp和3 219 bp,编码区由289个氨基酸组成;该蛋白为亲水性蛋白,无明显的信号肽,有2个跨膜区域;蛋白二级结构和三级结构主要由7个α-螺旋、7个β-折叠以及loop环构成。猪CBR1基因氨基酸序列与人、绵羊氨基酸的相似性较高,为84.48%。q RT-PCR结果表明,怀孕12 d的二花脸子宫内膜中CBR1基因m RNA的表达量极显著高于长大二元母猪;在怀孕12 d母猪9个组织中,CBR1在肾脏中的表达量最高,其次是肝脏和小肠。