红花脂质转运蛋白基因的克隆及表达分析
Cloning and Expression Analysis of Lipid Transfer Protein LTP Gene in Carthamus tinctorius作者机构:吉林农业大学生命科学学院长春130118 通化市第一中学通化134000 吉林农业大学生物反应器与药物开发教育部工程研究中心长春130118
出 版 物:《生物技术通报》 (Biotechnology Bulletin)
年 卷 期:2016年第32卷第7期
页 面:146-151页
学科分类:0710[理学-生物学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 090102[农学-作物遗传育种]
基 金:国家高技术研究发展计划("863")项目(2011AA100606) 吉林省教育厅"十三五"科学技术研究项目重点项目(吉教科合字179号) 国家自然科学基金资助项目(31201237) 吉林农业大学大学生创新创业项目(201610193046 201410193045) 吉林省科技厅中青年领军人才及优秀创新团队项目(20111815) 教育部博士点基金-青年教师基金项目(20122223120002)
摘 要:克隆红花脂质转运蛋白基因(Lipid transfer protein,LTP),并进行生物信息学及表达分析,旨为研究LTP在红花抵抗逆境胁迫中的作用提供依据。通过RT-PCR方法从红花种子中克隆LTP基因序列,通过生物信息学对该基因蛋白的特征进行分析,构建LTP与相关物种LTP的系统进化树,利用Real-time PCR方法分析在红花不同号组织中LTP基因的表达量。结果显示,LTP基因ORF全长294 bp,编码97个氨基酸,相对分子量为7.46 kD,等电点为8.91。红花LTP蛋白包含一个长为29个氨基酸残基的信号肽序列;该蛋白含有一个丝氨酸磷酸化位点;三级结构预测表明该蛋白是由3个α-螺旋和一个β-转角简单的缠绕在无规则卷曲上的简单结构。分子进化表明,红花LTP基因与十字花科的甘蓝型油菜进化关系最近。通过荧光定量PCR对红花LTP基因的组织表达特异性进行分析,结果表明Ct LTP在不同组织的表达水平具有显著差异,在种子和花中呈现高表达,而在其他组织中低表达。