内蒙古8种啮齿类动物细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因引物的优化研究

作     者：刘芳 常子丽 李建云 王建军 王浩珲 胡艳红 武正华 马志东 范龙兴 张忠兵 

作者机构：内蒙古地方病防治研究中心呼和浩特010031 内蒙古满洲里市疾病预防控制中心地方病防治科 

出 版 物：《中华地方病学杂志》 (Chinese Journal of Endemiology)

年 卷 期：2015年第34卷第5期

页      面：322-325页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 0905[农学-畜牧学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖] 

基　　金：2012年卫生公益性行业科研专项(201202021) 

主　　题：鼠疫 基因扩增 DNA引物 

摘      要：目的 确定内蒙古鼠疫自然疫源地8种啮齿类动物细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ （CO Ⅰ）基因扩增的最佳引物.方法 在内蒙古锡林郭勒盟和乌兰察布市,采集8个鼠种的动物,提取基因组DNA,选择6对已报道的扩增鼠CO Ⅰ基因的引物（F1/R1、F2/R2、F3/R3、F4/R4、VF/VR、F6/R6）,PCR扩增8个鼠种的CO Ⅰ基因,对扩增的产物进行测序,并对测序结果进行生物信息学分析和比较.结果 达乌尔黄鼠扩增CO Ⅰ基因的最佳引物为F3/R3,达乌尔鼠兔和蒙古兔尾鼠均为鸡尾酒引物VF/VR,大沙鼠、蒙古毛足鼠和布氏田鼠均为F6/R6,五趾跳鼠为F2/R2,子午沙鼠为F1/R1.8种啮齿动物的CO Ⅰ序列进行比对后,发现所有DNA条码都是物种所独有,每个物种都有各自的鉴别位点.结论 不同鼠种在扩增CO Ⅰ基因时需要相应种属特异性引物;扩增多种鼠种时,优先选择F6/R6引物或鸡尾酒引物,针对特殊鼠种可选择该鼠种特异引物进行扩增.