赤水乌骨鸡线粒体DNA控制区遗传多样性和进化分析

作     者：吴芸 李盼盼 闫吉美 杨凤 黄锡阳 

作者机构：遵义师范学院生物与农业科技学院贵州遵义563006 赤水市农业农村局畜牧渔业站贵州赤水564700 

出 版 物：《中国畜牧杂志》 (Chinese Journal of Animal Science)

年 卷 期：2024年第60卷第10期

页      面：127-132页

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖] 

基　　金：遵义师范学院“乡村振兴专项”项目(黔教合KY字017-17号) 

主　　题：赤水乌骨鸡 mtDNA 控制区 遗传多样性 系统进化 

摘      要：为探究赤水乌骨鸡线粒体DNA控制区的遗传多样性、单倍型特征和母系起源情况,利用PCR扩增和直接测序法检测了63只赤水乌骨鸡线粒体DNA (mitochondrial DNA, mtDNA)控制区(D-loop)全序列,分析其遗传多样性和单倍型特性,并与不同红色原鸡亚种的序列进行聚类分析。结果表明,赤水乌骨鸡mtDNA D-loop区全序列共检测到29个突变位点,构成19种单倍型。遗传多样性分析表明,单倍型多样性(Hd)、核苷酸多样性(Pi)和平均核苷酸差异数(K)分别为0.990 5±0.018 0、0.006 5±0.000 5和7.981。系统发育分析显示,赤水乌骨鸡19种单倍型可划分为A、B、C、E、G 5个单倍型群,A、B均分别与原鸡滇南亚种聚类,单倍型群C与原鸡印度亚种、原鸡滇南亚种和原鸡海南亚种聚为一类,E单倍型群分支与印度亚种和原鸡滇南亚种聚为一类。据此推测,赤水乌骨鸡遗传多样性丰富,可能有多个母系起源,主要源于原鸡滇南亚种。