基于SSR标记的青海蚕豆品种亲缘关系分析与指纹图谱构建

作     者：郑栋 周仙莉 滕长才 侯万伟 张红岩 刘玉皎 

作者机构：青海大学 青海省农林科学院 国家农作物种质资源复份库 青海大学省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室 

出 版 物：《作物学报》 (Acta Agronomica Sinica)

年 卷 期：2024年

核心收录：

学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090202[农学-蔬菜学] 

基　　金：青海省重点研发与转化计划项目(2022-NK-109) 财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-08-G06)资助 

主　　题：蚕豆 青海 主栽品种 SSR标记 亲缘关系 指纹图谱 

摘      要：为明确青海蚕豆育成品种、高代品系和骨干亲本的群体结构与亲缘关系，本研究利用46对多态性和稳定性好、重复性高的SSR引物对36个青海蚕豆主栽品种(品系)进行群体遗传学分析并构建了指纹图谱。结果表明，通过毛细管电泳检测，在46对引物中检测到262个等位位点，各引物检测的多态性等位位点数(Na)为2～15，平均等位位点数为5.696个，平均每个位点检测到的有效等位基因数为2.988个，范围为1.180～9.257；Shannon指数的变化范围为0.287～2.444，均值为1.210；多态性信息含量(polymorphism information content， PIC)值变化范围为0.141～0.883，均值为0.553，揭示了青海蚕豆品种丰富的遗传多样性。系统聚类将36份材料划分为4个亚群，第Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ亚群各包括24、4、7、1份材料，群体结构与主坐标分析将材料划分为2个亚群，亚群Ⅰ和亚群Ⅱ分别包括17和19份材料，与聚类分类结果有一定程度的交叉重合，厘清了青海蚕豆主栽品种的群体遗传结构与亲缘关系。在此基础上，筛选出4对核心引物，构建了36份材料的指纹图谱，并将相关信息储存在二维码中。青海蚕豆主栽品种指纹图谱的构建不仅为青海蚕豆品种鉴定提供了有效工具，也为今后青海蚕豆品种亲本选配和新品种权保护提供了技术支撑。