玉米病原真菌DNA条形码的筛选和特异性靶标基因的确定
作者机构:东港海关综合技术服务中心 辽宁省农业职业技术学院 大连海关技术中心
出 版 物:《玉米科学》 (Journal of Maize Sciences)
年 卷 期:2024年
核心收录:
学科分类:09[农学] 0904[农学-植物保护] 090401[农学-植物病理学] 090402[农学-农业昆虫与害虫防治]
基 金:海关总署科研项目(2023HK083) 大连海关科研项目(2023DK01) “十四五”国家重点研发计划课题(2021YFD1400100)
主 题:玉米 病原真菌 DNA条形码 筛选 甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因
摘 要:玉米是我国重要的粮食作物之一,本研究旨在确定玉米常见病原真菌理想的DNA条形码片段。通过统计分析DNA条形码在玉米病原真菌鉴定中的应用情况,选择使用率较高的ITS、GAPDH和TEF1基因,依据碱基替代饱和性分析,基于数据的统计学意义,确定3个基因序列适用于构建系统发育树。结合系统发育树和遗传变异差异性分析,确定GAPDH基因片段具有较理想的种群区分能力和遗传变异间距,具备作为DNA条形码的必备条件。GAPDH基因可用于玉米病原真菌特异性引物和探针的设计,揭示了玉米病原真菌的遗传结构和系统进化关系,为口岸监管和精准检测提供科学依据。