黄瓜疫霉菌ITS及β-tubulin的扩增和序列分析

作     者：丁婧 吴晓金 雷颖 易图永 Ding Jing;Wu Xiaojin;Lei Ying;Yi Tuyong

作者机构：湖南农业大学植物保护学院长沙410128 湖南省洪江市农业局湖南黔城418116 植物病虫害生物学与防控湖南省重点实验室长沙410128 湖南省生物农药与制剂加工工程技术研究中心长沙410128 

出 版 物：《中国农学通报》 (Chinese Agricultural Science Bulletin)

年 卷 期：2015年第31卷第32期

页      面：48-53页

学科分类：0710[理学-生物学] 071010[理学-生物化学与分子生物学] 07[理学] 

基　　金：湖南省高校创新平台建设项目"黄瓜疫霉菌遗传多样性的AFLP分析"(13K064) 农业部公益行业计划"蔬菜卵菌病害综合防控技术研究与示范"(201003004) 

主　　题：黄瓜疫霉菌 遗传多样性 系统发育树 ITS β-tubulin 序列分析 

摘      要：为研究不同来源地黄瓜疫霉菌的系统发育关系以及遗传多样性,从湖南省内5个黄瓜种植区采集具有典型症状的黄瓜疫病病株分离纯化,利用形态学方法观察孢子囊形态。再运用PCR技术分别进行ITS以及β-tubulin扩增测序并与Genbank的中相关序列构建系统发育树。经形态学初步鉴定22株黄瓜疫霉菌株,ITS-PCR序列长度约为780 bp,β-tubulin-PCR序列长度约为800 bp,所有测得序列与下载自Genbank的相关序列存在不同程度的相似性。ITS序列的系统发育分析,用于构建系统发育树的序列分为2个大的聚类I和II,黄瓜疫霉菌均位于I组内,由于来源地差异,不同地区的黄瓜疫霉菌又被聚在不同小类;β-tubulin序列在系统发育分析中被分为4个聚类,22个***序列与下载的***序列均在聚类组I中。聚类分析结果表明:疫霉属种群间具有明显的亲缘关系,不同地域的黄瓜疫霉菌遗传多样性表现出差异,但总体趋势是相同来源地的菌株亲缘性比较接近。