荷斯坦奶牛胚胎基因组遗传评估研究

作     者：郭子骄 郑伟杰 孙伟 吴宝江 包向男 张琪 贺巾锋 包斯琴 赵高平 王子馨 韩博 李喜和 孙东晓 GUO Zijiao;ZHENG Weijie;SUN Wei;WU Baojiang;BAO Xiangnan;ZHANG Qi;HE Jinfeng;BAO Siqin;ZHAO Gaoping;WANG Zixin;HAN Bo;LI Xihe;SUN Dongxiao

作者机构：中国农业大学动物科学技术学院农业农村部动物遗传育种与繁殖重点实验室动物育种国家工程实验室畜禽生物育种全国重点实验室北京100193 内蒙古赛科星家畜种业与繁育生物技术研究院有限公司呼和浩特011517 国家乳业技术创新中心呼和浩特010020 内蒙古大学生命科学学院呼和浩特010021 

出 版 物：《畜牧兽医学报》 (ACTA VETERINARIA ET ZOOTECHNICA SINICA)

年 卷 期：2024年第55卷第7期

页      面：2940-2950页

核心收录：

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖] 

基　　金：“国家乳业技术创新中心创建”重点专项(2021—国家乳创中心—3) 内蒙古自治区科技计划项目(2021GG0403) 国家重点研发计划(2021YFF1000700) 教育部创新团队发展计划(IRT_15R62) 

主　　题：荷斯坦奶牛 胚胎 基因组选择 

摘      要：旨在建立一种荷斯坦奶牛胚胎细胞早期基因组检测和遗传评估的方法并筛选优秀种用胚胎,通过胚胎移植技术选育优秀种牛,进一步缩短世代间隔,加快遗传进展。本研究基于4头荷斯坦种公牛克隆细胞,比较分析2细胞、5细胞的微量基因组DNA提取效果、全基因组芯片检出率及错配率;随后提取24枚荷斯坦奶牛早期胚胎5细胞样本的基因组DNA,利用150K芯片进行基因组检测;基于大规模基因组选择参考群体,采用GBLUP方法计算每枚胚胎9个性状的基因组育种值。结果表明,2和5克隆细胞的基因组DNA浓度、纯度和相对完整性均较好;5克隆细胞样品的150K芯片检出率较高(89.54%~95.07%)、错配率较低(1.02%~4.67%)。24枚胚胎的5细胞样品基因组DNA质量、总量和相对完整性均较好,150K芯片数据检出率为92.28%~98.51%,9个性状(产奶、体型和体细胞评分)基因组评估准确性为55%~79%,平均基因组评估准确性不低于65%。综上,本研究优化并建立了奶牛胚胎少量细胞DNA提取及基因组评估技术,胚胎样本基因组检出率不低于90%,平均基因组评估准确性不低于0.65。