2020-2021年上海市某哨点医院疱疹性咽峡炎流行特征及相关肠道病毒VP1基因特征分析
Epidemiological characteristics of herpetic angina and ananlysis of gene chacteristics of related enterovirus VP1 detected in a sentinel hospital in Shanghai,2020-2021作者机构:上海市疾病预防控制中心上海200336
出 版 物:《疾病监测》 (Disease Surveillance)
年 卷 期:2024年第39卷第4期
页 面:439-445页
核心收录:
学科分类:1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 1005[医学-中医学] 100705[医学-微生物与生化药学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学]
基 金:上海市加强公共卫生体系建设三年行动计划(No.2023-2025年) 超大城市生物安全关键能力和公共卫生实验室网络一体化建设(No.GWVI-3) 传染性病原体监测、菌毒种资源及生物安全关键底层技术研究(No.GWVI-11.1-09)
主 题:疱疹性咽峡炎 肠道病毒 VP1基因特征 柯萨奇病毒A组4型 柯萨奇病毒A组6型
摘 要:目的分析2020—2021年上海市某哨点医院疱疹性咽峡炎(HA)标本病例信息的流行病学及主要病原体VP1基因特征,为HA防控提供参考依据。方法采集2020—2021年上海市某哨点医院HA病例标本及信息进行描述性统计分析;采用实时荧光定量聚合酶链式反应开展肠道病毒血清型鉴定,对阳性标本进行病毒分离、VP1基因测序及基因进化、核苷酸及氨基酸同源性分析。结果155例HA标本中肠道病毒阳性病例95例,3~6岁学龄前儿童发病率最高,占确诊病例的57.90%。柯萨奇病毒(Cox)A组6型、Cox A4分别为2020和2021年引起HA的主要优势血清型,检出率分别为33.70%、29.50%,未发现肠道病毒(EV)71型、Cox A5等其他肠道病毒血清型感染病例。基于VP1基因区段,Cox A4、Cox A6、EV71、Cox A10和Cox A16基因型分别为C2 Cluster1、D3、C4a、C、B1b,自HA标本中分离的毒株与我国主要流行株的核苷酸同源性分别为92.60%~96.10%、89.70%~97.00%、92.00%~94.60%、90.70%~97.00%和92.20%~93.70%,氨基酸同源性分别为92.90%~96.20%、97.20%~99.70%、98.30%~99.30%、91.10%~97.10%和96.00%~97.10%。结论2020—2021年上海市某哨点医院HA易感人群以3~6岁学龄前儿童为主;Cox A6、Cox A4是HA的主要血清型;2021年,Cox A4成为引起HA最主要的血清型;所分离肠道病毒与我国优势流行株具有较高同源性。持续开展HA病原谱变化和病毒基因组特征监测对了解病毒传播及防控策略的制定具有参考意义。