基于转录组测序对不同月龄舍饲滩羊羔羊肌肉脂肪代谢相关基因差异表达分析

作     者：康燕 王小伟 杜佳文 张宁 李海波 徐晓锋 张力莉 KANG Yan;WANG Xiao-wei;DU Jia-wen;ZHANG Ning;LI Hai-bo;XU Xiao-feng;ZHANG Li-li

作者机构：宁夏大学动物科技学院宁夏银川750021 

出 版 物：《饲料研究》 (Feed Research)

年 卷 期：2024年第47卷第5期

页      面：60-65页

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 

基　　金：国家自然科学基金项目“日粮琥珀酸调控滩羊瘤胃菌群代谢及肉质性状的作用与机制(项目编号:32160797)” 

主　　题：滩羊 舍饲 肌肉组织 脂肪代谢 

摘      要：试验旨在探究在舍饲模式下不同月龄滩羊羔羊的肌肉组织脂肪代谢的相关差异表达基因。将体况相近的12只舍饲滩羊为研究对象,分别于2月龄和6月龄挑选3只体重相近的滩羊进行屠宰,取背最长肌和股二头肌。采用Illumina对背最长肌和股二头肌进行转录组测序,筛选脂肪代谢相关基因。结果显示,6月龄与2月龄滩羊羔羊股二头肌共筛选出差异表达基因146个,其中69个上调基因,77个下调基因。差异表达基因富集在40个GO条目中,主要在内皮细胞凋亡过程的调节、羧酸代谢过程及上皮细胞凋亡过程的负向调节等生物过程中。KEGG显著富集在4个通路中,与脂肪代谢密切相关的通路为过氧化物酶体增生物激活受体(PPAR)信号通路与脂肪细胞因子信号通路等。根据转录组数据分析血管生成样素蛋白4 (ANGPTL4)、脂肪酸合成酶(FASN)及肉毒碱棕榈酰基转移酶Ⅰ肝脏亚型(CPT1A)基因与脂肪代谢相关。6月龄与2月龄滩羊羔羊背最长肌共筛选出差异表达基因1 418个,其中774个上调基因,644个下调基因。GO富集主要体现在细胞-细胞黏附、单个生物体的细胞-细胞黏附及单个生物体的细胞黏附,KEGG显著富集在18个通路中,与脂肪代谢密切相关的为PPAR信号通路与脂肪酸代谢等通路。根据转录组数据分析瘦素(LEP)、胰岛素样生长因子2 (IGF2)、心脏型脂肪酸结合蛋白3 (FABP3)基因与脂肪代谢相关。研究表明,舍饲条件下,ANGPTL4、FASN、CPT1A基因在不同月龄滩羊羔羊股二头肌脂肪代谢过程中发生调节作用,而LEP、IGF2、FABP3基因对背最长肌脂肪代谢发挥调节作用。