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虎纹蛙及其它几种蛙科动物线粒体16S rRNA的空间结构分析

Secondary structure analysis of mitochondrial 16S rDNA among Hoplobatrachus rugulosus and the other frogs from ranidae

作     者:黄建伟 刘忠权 韩德民 HUANG Jian-wei;LIU Zhong-quan;HAN De-min

作者机构:安徽大学生命科学学院安徽省生态工程与生物技术重点实验室合肥230039 盐城师范学院生命科学与技术学院江苏盐城224051 

出 版 物:《生物学杂志》 (Journal of Biology)

年 卷 期:2010年第27卷第4期

页      面:15-18,14页

学科分类:0710[理学-生物学] 071010[理学-生物化学与分子生物学] 07[理学] 071002[理学-动物学] 

基  金:江苏省高校自然科学(重大)基础研究项目(07KJA18017 06KJB180122) 江苏省滩涂生物资源与环境保护重点建设实验室开放课题项目(JLCBE05010) 

主  题:线粒体 16S rRNA基因 蛙科 空间结构 分类地位 

摘      要:测定了虎纹蛙16S rRNA基因全序列,并从GeneBank上下载了5种蛙科动物同源序列,利用CLUSTAL与MEGA3.1软件比较了种间的序列差异,用RNAdraw软件推测分析二级结构的空间构象,并根据空间结构对这6种蛙科动物的分类地位进行讨论分析。结果表明:虎纹蛙与黑斑蛙的二级结构最为相似,与泽蛙结构大体一致,而与黑斑蛙同属的金线蛙则表现出较大的差异;凹耳蛙与上述几种差别较大;福建大头娃与这几种蛙科动物差距最为明显。空间结构分析与序列比较结果存在一定的差异。

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