一种外三元纯种猪、二元猪、三元猪和多元回交猪的鉴定方法研究

作     者：郑春婷 胡云洋 张春光 叶子源 张琛 罗云燕 秦蕾 彭子璇 于亦飞 冼旺莹 楚菡 洪亮 张建斌 蒲蕾 ZHENG Chunting;HU Yunyang;ZHANG Chunguang;YE Ziyuan;ZHANG Chen;LUO Yunyan;QIN Lei;PENG Zixuan;YU Yifei;XIAN Wangying;CHU Han;HONG Liang;ZHANG Jianbin;PU Lei

作者机构：天津市绿色生态饲料重点实验室天津301800 天津农学院动物科学与动物医学学院天津市农业动物繁育与健康养殖重点实验室天津300392 

出 版 物：《中国畜牧兽医》 (China Animal Husbandry & Veterinary Medicine)

年 卷 期：2024年第51卷第3期

页      面：1160-1170页

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 08[工学] 0905[农学-畜牧学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0836[工学-生物工程] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖] 

基　　金：天津市科技计划项目(23ZYCGSN00230) 大学生创新创业训练项目(202310061006) 天津市绿色生态饲料重点实验室(TJ202302) 天津市生猪产业技术体系创新团队(ITTPRS2024006) 

主　　题：外三元猪 芯片比对 单核苷酸多态性(SNP) 种质鉴定 

摘      要：【目的】获得外三元猪品种鉴定的有效基因型并建立系统的猪种质鉴定方案,为外三元猪种质鉴定提供思路。【方法】本研究对613头杜洛克猪Illumina 60K芯片、503头长白猪Illumina中芯一号50K芯片及10头大白猪重测序数据进行纯合位点统计分析,筛选获得常染色体上杜洛克猪、长白猪、大白猪的特异性单核苷酸多态性(SNP)位点。以120头不同品系不同品种猪耳组织DNA为模板进行PCR扩增,并测序验证特异性SNP位点,筛选有效的特异性基因位点,通过位点联合分析建立外三元纯种、二元、三元及多元回交猪品种鉴定方案。【结果】通过芯片数据比对共获得6个长白猪特有SNPs位点,8个杜洛克猪特有的SNPs位点,1个大白猪特有SNP位点。测序验证结果显示有效SNPs位点分别为SSC13:57293969 AG、SSC11:47494227 TG、SSC6:110653413 TC和SSC6:110653219 TC。根据位点突变类型及遗传规律,制定了三位点联合分析的种质鉴定方案,并鉴定出长白纯种猪、多元回交长白猪等多个猪种。【结论】本研究利用猪种特异性SNP位点制定了外三元纯种、二元、三元及多元回交猪品种鉴定方案。试验结果为外三元猪种质鉴定提供参考和技术支撑。