崂山奶山羊不同泌乳期乳腺组织可变剪接的鉴定与分析

作     者：楚云鹏 鞠林 李培培 晁天乐 王建民 纪志宾 商营利 张彤晨 王勇 亓宝华 薛海鹏 CHU Yun-peng;JU Lin;LI Pei-pei;CHAO Tian-le;WANG Jian-min;JI Zhi-bin;Shang Ying-li;ZHANG Tong-chen;WANG Yong;QI Baohua;XUE Hai-peng

作者机构：山东农业大学动物科技学院山东泰安271018 青岛市畜牧兽医研究所山东青岛266000 利津县动物疫病预防控制中心山东利津257400 黄河口滩羊产业研究院山东利津257400 济南市畜牧技术推广站山东济南250308 

出 版 物：《山东农业大学学报（自然科学版）》 (Journal of Shandong Agricultural University：Natural Science Edition)

年 卷 期：2024年第55卷第1期

页      面：108-115页

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 

基　　金：国家自然科学基金面上项目(31672401) 山东省羊产业技术体系综合试验站项目(SDAIT-22-15) 

主　　题：奶山羊 乳腺 可变剪接 RNA测序 

摘      要：本研究对崂山奶山羊泌乳初期、高峰期和末期乳腺组织RNA-Seq数据进行可变剪接分析,共鉴定到151503个可变剪接事件,对应17627个可变剪接基因,6323个差异剪接基因,显著富集到细胞器、蛋白质结合、mRNA加工和RNA剪接等相关GO条目,主要参与催产素信号通路、钙信号通路、内质网中的蛋白质加工等,与乳腺组织生理活性密切相关的KEGG通路,筛选出PTEN作为参与乳腺发育及泌乳相关生理过程中调控网络的核心基因。研究结果表明,可变剪接在奶山羊不同泌乳期的乳腺组织具有发育阶段特异性,特有可变剪接基因与乳腺组织生理活性特点密切相关,在调控奶山羊乳腺组织发育及泌乳生理中发挥重要作用。本研究可为探究可变剪接机制调控奶山羊乳腺发育与泌乳性状的分子机理提供理论依据。