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崂山奶山羊不同泌乳期乳腺组织可变剪接的鉴定与分析

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山东农业大学学报（自然科学版） 2024年第1期55卷 108-115页

作者：楚云鹏鞠林李培培晁天乐王建民纪志宾商营利张彤晨王勇亓宝华薛海鹏山东农业大学动物科技学院山东泰安271018 青岛市畜牧兽医研究所山东青岛266000 利津县动物疫病预防控制中心山东利津257400 黄河口滩羊产业研究院山东利津257400 济南市畜牧技术推广站山东济南250308

本研究对崂山奶山羊泌乳初期、高峰期和末期乳腺组织RNA-Seq数据进行可变剪接分析,共鉴定到151503个可变剪接事件,对应17627个可变剪接基因,6323个差异剪接基因,显著富集到细胞器、蛋白质结合、mRNA加工和RNA剪接等相关GO条目,主要参与... 详细信息

本研究对崂山奶山羊泌乳初期、高峰期和末期乳腺组织RNA-Seq数据进行可变剪接分析,共鉴定到151503个可变剪接事件,对应17627个可变剪接基因,6323个差异剪接基因,显著富集到细胞器、蛋白质结合、mRNA加工和RNA剪接等相关GO条目,主要参与催产素信号通路、钙信号通路、内质网中的蛋白质加工等,与乳腺组织生理活性密切相关的KEGG通路,筛选出PTEN作为参与乳腺发育及泌乳相关生理过程中调控网络的核心基因。研究结果表明,可变剪接在奶山羊不同泌乳期的乳腺组织具有发育阶段特异性,特有可变剪接基因与乳腺组织生理活性特点密切相关,在调控奶山羊乳腺组织发育及泌乳生理中发挥重要作用。本研究可为探究可变剪接机制调控奶山羊乳腺发育与泌乳性状的分子机理提供理论依据。

关键词：奶山羊乳腺可变剪接 RNA测序

崂山奶山羊线性外貌评定分析及其与泌乳性状相关性分析

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山东畜牧兽医 2024年第5期45卷 5-8页

作者：汪浩源王舒君楚云鹏李培培晁天乐纪志宾张彤晨牟海军王新霞任志强王勇李强亓宝华薛海鹏山东农业大学动物科技学院山东泰安271018 山东省青岛市畜牧兽医研究所山东青岛山东省利津县动物疫病预防控制中心山东利津山东省黄河口滩羊产业研究院山东利津山东省济南市畜牧技术推广站山东济南

本研究采用牛的线性外貌鉴定方法对青岛奥特种羊场的149只崂山奶山羊母羊进行了线性外貌评定,对其评定结果与泌乳量进行了相关性分析以验证该方法在崂山奶山羊群体上是否适用,并对结果进了分析。相关性分析结果显示,泌乳量与一般外貌评... 详细信息

本研究采用牛的线性外貌鉴定方法对青岛奥特种羊场的149只崂山奶山羊母羊进行了线性外貌评定,对其评定结果与泌乳量进行了相关性分析以验证该方法在崂山奶山羊群体上是否适用,并对结果进了分析。相关性分析结果显示,泌乳量与一般外貌评分呈显著正相关(r=0.167,P天泌乳量的相关性分析确定该方法在崂山奶山羊群体中的适用性,为今后育种工作提供选种理论支持,为正确评价崂山奶山羊经济价值提供科学依据。

关键词：崂山奶山羊线性外貌分析泌乳性状

绵羊臂二头肌转录组新转录本及新长非编码RNA的鉴别与验证

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绵羊臂二头肌转录组新转录本及新长非编码RNA的鉴别与验证

作者：晁天乐山东农业大学

学位级别：硕士

近年来,全转录组高通量测序技术(RNA-seq)技术被广泛应用于绵羊的功能基因组学研究当中。转录组高通量测序技术能够快速全面的获得特定组织处于某个状态下的几乎所有转录本,该技术的这一特点使得我们能够发现组织中未经注释的新转录本,... 详细信息

近年来,全转录组高通量测序技术(RNA-seq)技术被广泛应用于绵羊的功能基因组学研究当中。转录组高通量测序技术能够快速全面的获得特定组织处于某个状态下的几乎所有转录本,该技术的这一特点使得我们能够发现组织中未经注释的新转录本,进而鉴别出新的基因信息。本研究采用生物信息学技术和半定量RT-PCR技术,对小尾寒羊和杜泊羊的臂二头肌转录组文库中的新转录本及新长非编码RNA进行了发掘、鉴别和验证。取得研究结果如下:(1)在两个转录组文库间,发现了共同表达的转录本40129条,并从中识别出在现有绵羊参考基因组中无注释信息的新转录本5553条。(2)对新转录本进行序列同源性比对分析和人工筛选鉴别,从中鉴别出分属473个已注释基因的634条新转录本,分属27个新基因的49条新转录本,分属88个长非编码RNA位点的100条新转录本,分属4个假基因的4条新转录本,以及分属27个未知蛋白位点的30条新转录本。(3)通过对未能获得鉴别,且编码潜能预测结果为非编码的新转录本进行进一步分析,从中预测出分属于2282个位点的2312条高可信度长非编码RNA转录本。并为其中620条长非编码RNA预测了547个互作基因,通过对互作基因的注释预测了长非编码RNA的功能,从中揭示出113条可能与骨骼肌生长发育相关的长非编码RNA。。(4)从获得鉴别结果的新转录本与长非编码RNA中选择15条进行克隆测序,并利用测序结果验证外显子结构,结果13条转录本克隆并检验成功。使用半定量RT-PCR对12条新转录本与长非编码RNA进行组织间表达分析,发现其在不同组织间存在差异表达,并发现部分新转录本在骨骼肌或其他组织中特异性表达。综上所述,本研究借助生物信息学技术和分子生物学实验技术,从小尾寒羊和杜泊羊的臂二头肌转录组文库中成功发掘并鉴别了一批新转录本,从中注释了一批新基因,预测出一批新长非编码RNA,并进而对鉴别和预测结果进行了试验验证。本研究为绵羊基因组提供了补充性的注释信息,也为下一步开展对骨骼肌中转录调控机制的研究建立了基础。

关键词：转录组新转录本生物信息学长非编码RNA 半定量RT-PCR

循环miRNA生物标记物的运动生理研究进展

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山东农业大学学报（自然科学版） 2022年第1期53卷 163-170页

作者：陈淑婷晁天乐刘文萍山东农业大学体育学院山东泰安271018 山东农业大学动物科技学院山东泰安271018 泰安市精神病医院山东泰安271018

运动是维持健康和预防疾病的最佳方法之一,而miRNA被认为是运动后体增益相关分子机制的关键调控因子。循环miRNA因其稳定性、分布广泛性、以及易检测性,特别有望成为未来的运动相关非侵入性生物标记物。基于循环miRNA的优点,构建比目前... 详细信息

运动是维持健康和预防疾病的最佳方法之一,而miRNA被认为是运动后体增益相关分子机制的关键调控因子。循环miRNA因其稳定性、分布广泛性、以及易检测性,特别有望成为未来的运动相关非侵入性生物标记物。基于循环miRNA的优点,构建比目前更易用、更精准的运动效果、运动能力评估方法,将积极影响当前的运动评估方法,并更好地监测运动反应。这篇综述总结了循环miRNA的当前知识,与运动有关的循环miRNA的最新研究进展,并论述了它们作为运动相关生物标记物的作用和前景。

关键词：循环miRNA 运动生理生物标记物

面向模分复用的少模光纤熔接失准容忍度分析方法

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光学学报 2024年第14期44卷 47-56页

作者：刘峰黄自成顾天乐毛建龙温州大学电气与电子工程学院浙江温州325035

提出基于拉盖尔-高斯模的少模光纤熔接失准容忍度分析理论模型,剖析不同少模光纤归一化截止频率和纤芯半径参数熔接条件下,熔接点处空间模式耦合效率对横向偏移、旋转角度等熔接参数的容忍度变化规律,并以六模光纤(可支持LP_(01)、LP_(1... 详细信息

提出基于拉盖尔-高斯模的少模光纤熔接失准容忍度分析理论模型,剖析不同少模光纤归一化截止频率和纤芯半径参数熔接条件下,熔接点处空间模式耦合效率对横向偏移、旋转角度等熔接参数的容忍度变化规律,并以六模光纤(可支持LP_(01)、LP_(11a)、LP_(11b)、LP_(21a)、LP_(21b)和LP_(02)模式)熔接为例进行分析。数值分析结果表明,在不同光纤参数归一化截止频率V和纤芯半径a条件下,不同空间模式之间的耦合效率对熔接横向偏移量d和角度失配θ的容忍度呈现不同的分布规律。发送与接收少模光纤的V值相差越大,LP_(01)自耦合效率对熔接横向偏移量的容忍度越低,而不同纤芯半径a下熔接偏移量对自耦合效率的影响较光纤V的影响更显著等。因此,针对不同参数少模光纤熔接,需要严格控制熔接的横向偏移和角度失配,以达到理想的空间模式熔接耦合效率。该理论模型为评估少模光纤熔接质量及熔接参数匹配设计与优化提供了理论依据。

关键词：光通信模分复用少模光纤光纤熔接耦合效率容忍度

奶山羊乳腺组织中差异表达microRNAs鉴定与分析

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奶山羊乳腺组织中差异表达microRNAs鉴定与分析

精密纳秒激光微刻蚀系统的设计与加工实验研究

2015年全国养羊生产与学术研讨会

作者：纪志宾王桂芝王建民刘昭华候磊晁天乐山东农业大学动物科技学院

引言microRNAs在真核生物中具有特异的时空及组织表达模式,参与了器官发育、特定细胞过程,以及人类疾病等精细调控。近年来,对乳腺发育进程研究表明,miRNAs作为一类重要的调控因子,通过调控基因表达参与了乳腺发育过程,但miRNAs在山羊...

引言microRNAs在真核生物中具有特异的时空及组织表达模式,参与了器官发育、特定细胞过程,以及人类疾病等精细调控。近年来,对乳腺发育进程研究表明,miRNAs作为一类重要的调控因子,通过调控基因表达参与了乳腺发育过程,但miRNAs在山羊正常乳腺生理与泌乳的研究相对较少。因此,本研究以5只健康的崂山奶山羊不同泌乳时期的乳腺组织为研究对象,采用Illumina/Solexa Sequencing技术鉴定乳腺组织中表达的miRNAs,并采用生物信息学分析其功能。材料方法崂山奶山羊泌乳初期、高峰期和末期乳腺组织(产后20天、90天和210天),提取总RNA

关键词：

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精密纳秒激光微刻蚀系统的设计与加工实验研究

作者：奚天乐大连交通大学

学位级别：硕士

中国奶山羊线粒体DNA D-loop区遗传多样性与起源进化研究

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中国奶山羊线粒体DNA D-loop区遗传多样性与起源进化研究

2015年全国养羊生产与学术研讨会

作者：王桂芝皮秀双纪志宾秦孜娟侯磊晁天乐王建民山东农业大学动科院

引言/目的我国没有专门化的奶山羊品种,现有的优良奶山羊品种都是引进国外奶山羊品种培育而成。本研究利用线粒体DNA对9个中国奶山羊品种进行研究,测定了162只奶山羊个体的线粒体D-loop区全序列,通过群体遗传结构、亲缘关系、系统进化...

引言/目的我国没有专门化的奶山羊品种,现有的优良奶山羊品种都是引进国外奶山羊品种培育而成。本研究利用线粒体DNA对9个中国奶山羊品种进行研究,测定了162只奶山羊个体的线粒体D-loop区全序列,通过群体遗传结构、亲缘关系、系统进化和群体扩张等几方面对中国奶山羊进行遗传多样性和起源进行了探讨研究。材料方法从中国四个省市采集了6个奶山羊品种和3个对照山羊品种共162只血液样本。其中包括4个中国培育奶山羊品种(西农萨能奶山羊、文登奶山羊、关中奶山羊、崂山奶山羊),2个国外引进奶山羊品种(努比亚奶山羊、萨能奶山羊)和3个本地山羊品种(简阳大耳羊、莱芜黑山羊、

关键词：

来源： cnki会议评论

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隧道内超宽带车载标签跟踪方法

导航定位学报 2024年第4期12卷 181-189页

作者：吴尧帅费天乐河南顺博智能科技有限公司郑州450000 中央兰开夏大学工程学院兰开夏郡普雷斯顿PR12HE

针对隧道中车辆跟踪难、精度不高的问题,设计了一个基于超宽带技术(UWB)的车载标签跟踪方法。在跟踪算法上,首先利用基于UWB的到达时间差(TDOA)算法对车载标签进行实时定位;再通过一种适用于隧道特征的自适应卡尔曼滤波方法,有效估计了... 详细信息

针对隧道中车辆跟踪难、精度不高的问题,设计了一个基于超宽带技术(UWB)的车载标签跟踪方法。在跟踪算法上,首先利用基于UWB的到达时间差(TDOA)算法对车载标签进行实时定位;再通过一种适用于隧道特征的自适应卡尔曼滤波方法,有效估计了隧道内车载标签位置。在硬件设计上,将STM32系列芯片作为中央处理器(CPU),DW1000作为核心通信元器件制作了基站与车载标签。在京广路隧道进行实验测试与分析,结果表明该方法在隧道内能够对车辆进行跟踪,且整体误差小于30 cm,实现了车辆在隧道内的实时跟踪。

关键词：超宽带技术到达时间差自适应卡尔曼滤波车载标签