基于ITS条形码的滇鸡血藤及混伪品分子鉴定

作     者：刘心雨 姜丹 杨楚楚 徐庆一 徐裕彬 陈绪军 任广喜 刘春生 LIU Xin-yu;JIANG Dan;YANG Chu-chu;XU Qing-yi;XU Yu-bin;CHEN Xu-jun;REN Guang-xi;LIU Chun-sheng

作者机构：北京中医药大学中药学院北京102488 北京橘井健康科技集团有限公司北京100068 北京卫仁中药饮片厂有限公司北京101300 

出 版 物：《中国现代中药》 (Modern Chinese Medicine)

年 卷 期：2024年第26卷第1期

页      面：10-17页

学科分类：1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学] 

基　　金：中央高校横向课题项目(2021110031010987) 

主　　题：滇鸡血藤 内转录间隔区序列 DNA条形码 单核苷酸多态性 单倍型数据库 

摘      要：目的:基于内转录间隔区(ITS)序列,运用DNA条形码技术对滇鸡血藤药材及其混伪品进行序列比对分析,根据单核苷酸多态性位点构建滇鸡血藤单倍型数据库,建立快速、准确鉴定滇鸡血藤的分子鉴定方法。方法:以滇鸡血藤及其混伪品为材料,利用DNA提取试剂盒,分别提取滇鸡血藤及其混伪品的总DNA,对ITS序列进行聚合酶链式反应扩增及测序分析,使用DNAMAN软件统计其片段长度及变异位点个数,使用MEGA软件对数据进行分析比对,计算Kimura2-parameter遗传距离,并利用邻接法建立系统发育树进行分析。结果:滇鸡血藤ITS序列片段长度为675 bp,共包括19种单倍型,与其主要混伪品的差异位点为212、223、224 bp,系统发育树显示,ITS序列能够区分滇鸡血藤及其混伪品。结论:ITS条形码可以作为区分鉴定滇鸡血藤及其混伪品的分子条形码,包含19个单倍型的单倍型数据库覆盖了滇鸡血藤全部的单倍型。