基于RNA-Seq技术初步探索顺铂在口腔鳞状细胞癌的相关耐药机制

作     者：张万林 李一村 杨宏宇 Zhang Wanlin;Li Yicun;Yang Hongyu

作者机构：遵义医科大学口腔医学院贵州遵义563099 北京大学深圳医院口腔医学中心口腔颌面外科广东深圳518036 

出 版 物：《遵义医科大学学报》 (Journal of Zunyi Medical University)

年 卷 期：2024年第47卷第1期

页      面：53-61页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：深圳市科技创新委员会基础研究重点项目(NO:JCYJ20220818102816036) 

主　　题：口腔鳞癌 顺铂 化疗 耐药 差异基因 生物信息学 

摘      要：目的 探索口腔鳞状细胞癌(简称口腔鳞癌)顺铂化疗耐药的相关基因及信号通路。方法 建立顺铂诱导的口腔鳞癌细胞耐药模型,将顺铂耐药细胞(HN6-R)与非顺铂耐药细胞(HN6-WT_Control)进行转录组RNA-Seq测序分析,筛选两组中差异表达的基因(DEGs),利用生物信息学方法分析差异基因及相关信号通路。结果 测序结果显示顺铂耐药细胞与非顺铂耐药细胞有216个基因发生显著变化(log_(2)Fold Change, log_(2)FC1;adjusted P value0.05),其中55个基因下调,161个基因上调。对耐药细胞中上调的基因进行了基因富集分析(GSEA)确定了潜在的耐药相关通路,其中包括IL6/JAK2/STAT3信号通路、TNF-α和NF-κB信号通路、低氧通路、干扰素-γ应答和干扰素-α的应答通路等,其中变化最显著的基因为CXCL10、CXCL11、NR4A3和IGFBP3等。结论 IL6/JAK2/STAT3等信号通路在口腔鳞癌顺铂耐药细胞株中显著上调,可能成为预测口腔鳞癌化疗疗效的标志物及潜在的治疗靶点。