谷子花青苷合成相关基因的鉴定与生物信息学分析

作     者：赵孟瑶 康庆芳 赵影 李雪垠 

作者机构：山西农业大学生命科学学院 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2023年

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：国家重点研发计划项目(2018YFD1000700 2018YFD1000706) 国家自然科学基金(31801434) 山西农业大学科技创新基金项目(2017YJ28)共同资助 

主　　题：谷子 花青苷 结构基因 生物信息学 

摘      要：花青苷在植物生长发育过程中具有多种生理功能，鉴定谷子花青苷合成相关基因，为谷子花青苷合成机制与相关基因功能研究提供理论依据。利用谷子的全基因组数据库以及水稻和拟南芥花青苷合成相关基因，通过多种生物信息软件及在线网站对谷子花青苷合成相关基因进行鉴定，并分析其蛋白质理化性质、系统进化、基因位置、基因结构、启动子顺式作用元件、GO注释与组织表达情况。在谷子中共比对到20类共59个花青苷合成相关基因；谷子与水稻花青苷合成相关基因有更近的亲缘关系；同一类谷子花青苷合成相关基因的基因结构较为相似；谷子花青苷合成相关基因的启动子顺式作用元件中，与光、茉莉酸甲酯和脱落酸相关的响应元件个数最多；谷子花青苷合成相关基因的表达具有组织特异性，大部分基因的表达在灌浆期达到最高水平，在成熟籽粒中只有个别基因高表达。谷子大部分花青苷合成相关基因的表达在灌浆期达到最高水平，光、干旱胁迫、茉莉酸甲酯和脱落酸与谷子花青苷合成存在紧密联系。