基于分子对接和药效团的磷脂酶PLA2G1B抑制剂的虚拟筛选

作     者：王玉婷 刘霞 彭媛媛 王潇婕 赵琳静 WANG Yuting;LIU Xia;PENG Yuanyuan;WANG Xiaojie;ZHAO Linjing

作者机构：上海工程技术大学化学化工学院上海201620 

出 版 物：《上海工程技术大学学报》 (Journal of Shanghai University of Engineering Science)

年 卷 期：2022年第36卷第3期

页      面：295-300页

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100701[医学-药物化学] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金项目资助(31701032) 

主　　题：PLA2G1B抑制剂 类黄酮 分子对接 药效团 虚拟筛选 

摘      要：磷脂酶PLA2G1B与饮食诱导肥胖及相关代谢紊乱密切联系,研究表明一些天然类黄酮化合物对磷脂酶有抑制作用.采用整合分子对接和药效团策略筛选PLA2G1B靶向小分子抑制剂.对5种类黄酮化合物与PLA2G1B靶标进行分子模拟对接,分析其相互作用,建立基于配体分子共同特征(HipHop)的药效团模型,应用该模型对ZINC数据库中小分子化合物进行筛选,并对匹配评分良好的化合物进行类药性和药代动力学性质(ADME)预测分析.结果表明,山柰酚、木犀草素、槲皮素、杨梅素和表没食子儿茶素没食子酸酯与PLA2G1B均能较好结合,结合能为-7.17~-6.17 kJ/mol;所构建的药效团模型含有3个氢键供体和1个氢键受体4个特征元素;通过对ZINC数据库中10897个小分子的筛选,共得到722个分子,命中率为6.6%.其中匹配评分2.5的29个化合物均满足Lipinski规则,大部分化合物的ADME参数良好.研究结果为PLA2G1B抑制剂设计及先导化合物发现提供了参考数据.